45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2267 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2267  putative proline rich signal peptide protein  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4527  putative proline rich signal peptide protein  60.95 
 
 
217 aa  205  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3242  hypothetical protein  53.09 
 
 
197 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3893  hypothetical protein  53.09 
 
 
223 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.994478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0514  putative proline rich signal peptide protein  54.49 
 
 
187 aa  194  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0592  putative proline rich signal peptide protein  50.27 
 
 
215 aa  187  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3589  putative proline rich signal peptide protein  50 
 
 
203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03554  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4435  putative proline rich signal peptide protein  48.85 
 
 
214 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3631  putative proline rich signal peptide protein  45.64 
 
 
219 aa  171  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0868148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0273  hypothetical protein  39.08 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440817  decreased coverage  0.00233416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3561  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  35.91 
 
 
276 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3404  proline rich signal peptide protein  36.47 
 
 
291 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4002  hypothetical protein  37.13 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000676409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0076  proline rich signal peptide protein  36.32 
 
 
256 aa  111  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0426414  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0029  proline rich signal peptide protein  34.72 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3673  putative proline rich signal peptide protein  34.2 
 
 
256 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3350  proline rich signal peptide protein  35.42 
 
 
256 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2076  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  30.26 
 
 
193 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0314  hypothetical protein  33.51 
 
 
199 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4411  hypothetical protein  33.51 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92645 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3119  hypothetical protein  30.22 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.924603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4085  hypothetical protein  33.11 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0133  hypothetical protein  28.02 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3060  hypothetical protein  33.11 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0147  hypothetical protein  27.81 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.583084  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2358  hypothetical protein  27.81 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0156  hypothetical protein  27.81 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2280  hypothetical protein  27.81 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2800  hypothetical protein  27.81 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3177  hypothetical protein  33.11 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0351  hypothetical protein  27.81 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0166  hypothetical protein  27.81 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3122  hypothetical protein  32.4 
 
 
196 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3138  hypothetical protein  32.4 
 
 
196 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2508  hypothetical protein  32.4 
 
 
196 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6473  hypothetical protein  30.68 
 
 
196 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1774  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.45 
 
 
180 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.585717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0040  hypothetical protein  31.85 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0391  proline rich signal peptide protein  30.61 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0017  proline rich signal peptide protein  31.82 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0183  putative proline rich signal peptide protein  26.32 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000332053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2625  hypothetical protein  25.95 
 
 
196 aa  61.2  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2082  hypothetical protein  20.45 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0198  hypothetical protein  28.68 
 
 
183 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2270  conserved hypothetical protein, proline rich; putative membrane anchored protein  41.54 
 
 
189 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00227194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>