47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4527 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4527  putative proline rich signal peptide protein  100 
 
 
217 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3242  hypothetical protein  57.81 
 
 
197 aa  228  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3893  hypothetical protein  57.29 
 
 
223 aa  228  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.994478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2267  putative proline rich signal peptide protein  59.89 
 
 
203 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0514  putative proline rich signal peptide protein  54.84 
 
 
187 aa  201  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3589  putative proline rich signal peptide protein  50.26 
 
 
203 aa  201  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0592  putative proline rich signal peptide protein  49.24 
 
 
215 aa  198  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4435  putative proline rich signal peptide protein  53.18 
 
 
214 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3631  putative proline rich signal peptide protein  48.96 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0868148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0273  hypothetical protein  44.95 
 
 
202 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440817  decreased coverage  0.00233416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4002  hypothetical protein  45.18 
 
 
189 aa  128  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000676409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3404  proline rich signal peptide protein  38.32 
 
 
291 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0076  proline rich signal peptide protein  40.78 
 
 
256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0426414  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3350  proline rich signal peptide protein  39.52 
 
 
256 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3673  putative proline rich signal peptide protein  38.92 
 
 
256 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2076  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  36.67 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3561  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  36.59 
 
 
276 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4411  hypothetical protein  35.91 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0314  hypothetical protein  35.36 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4085  hypothetical protein  37.82 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0029  proline rich signal peptide protein  37.3 
 
 
203 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0040  hypothetical protein  35.06 
 
 
196 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1774  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  34.18 
 
 
180 aa  104  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.585717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3119  hypothetical protein  33.7 
 
 
196 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.924603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6473  hypothetical protein  34.08 
 
 
196 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2508  hypothetical protein  34.08 
 
 
196 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3122  hypothetical protein  34.08 
 
 
196 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3138  hypothetical protein  34.08 
 
 
196 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0147  hypothetical protein  31.84 
 
 
196 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.583084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0166  hypothetical protein  31.84 
 
 
196 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0156  hypothetical protein  31.84 
 
 
196 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2280  hypothetical protein  31.84 
 
 
196 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2800  hypothetical protein  31.84 
 
 
196 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0351  hypothetical protein  31.84 
 
 
196 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2358  hypothetical protein  31.84 
 
 
196 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0133  hypothetical protein  31.28 
 
 
196 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3060  hypothetical protein  34.87 
 
 
197 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3177  hypothetical protein  34.87 
 
 
197 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0391  proline rich signal peptide protein  33.9 
 
 
205 aa  94.7  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0017  proline rich signal peptide protein  32.95 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2625  hypothetical protein  30.6 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0183  putative proline rich signal peptide protein  27.06 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000332053 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2082  hypothetical protein  23.64 
 
 
210 aa  48.5  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2270  conserved hypothetical protein, proline rich; putative membrane anchored protein  36.27 
 
 
189 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00227194 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0190  hypothetical protein  26.67 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0198  hypothetical protein  27.97 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3017  hypothetical protein  23.49 
 
 
197 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>