49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_4085 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_4085  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  400  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0029  proline rich signal peptide protein  47.9 
 
 
203 aa  168  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3350  proline rich signal peptide protein  40 
 
 
256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3673  putative proline rich signal peptide protein  39.23 
 
 
256 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0076  proline rich signal peptide protein  38.15 
 
 
256 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0426414  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3404  proline rich signal peptide protein  39.39 
 
 
291 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0133  hypothetical protein  39.88 
 
 
196 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3561  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  40.4 
 
 
276 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0040  hypothetical protein  38.12 
 
 
196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0391  proline rich signal peptide protein  40.64 
 
 
205 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2800  hypothetical protein  36.72 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2358  hypothetical protein  36.72 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0166  hypothetical protein  36.72 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0156  hypothetical protein  36.72 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2280  hypothetical protein  36.72 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0147  hypothetical protein  36.72 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.583084  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0351  hypothetical protein  36.72 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3119  hypothetical protein  36.26 
 
 
196 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.924603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6473  hypothetical protein  35.71 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1774  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  37.14 
 
 
180 aa  124  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.585717 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3122  hypothetical protein  34.62 
 
 
196 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3177  hypothetical protein  37.11 
 
 
197 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3060  hypothetical protein  37.11 
 
 
197 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3138  hypothetical protein  34.62 
 
 
196 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2508  hypothetical protein  34.62 
 
 
196 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3893  hypothetical protein  36.87 
 
 
223 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.994478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0514  putative proline rich signal peptide protein  36.9 
 
 
187 aa  120  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0183  putative proline rich signal peptide protein  35.84 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000332053 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2076  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  36.22 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4411  hypothetical protein  36.2 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3242  hypothetical protein  36.87 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0017  proline rich signal peptide protein  37.29 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0314  hypothetical protein  36.2 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0273  hypothetical protein  35.42 
 
 
202 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440817  decreased coverage  0.00233416 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4527  putative proline rich signal peptide protein  37.82 
 
 
217 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0592  putative proline rich signal peptide protein  32.66 
 
 
215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4435  putative proline rich signal peptide protein  35.15 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3589  putative proline rich signal peptide protein  34.2 
 
 
203 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3631  putative proline rich signal peptide protein  30.73 
 
 
219 aa  99  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0868148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4002  hypothetical protein  35.86 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000676409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2267  putative proline rich signal peptide protein  33.11 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2625  hypothetical protein  33.54 
 
 
196 aa  89  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2082  hypothetical protein  28.08 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2846  hypothetical protein  29.75 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0198  hypothetical protein  31.97 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3017  hypothetical protein  26.62 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0190  hypothetical protein  24.11 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2270  conserved hypothetical protein, proline rich; putative membrane anchored protein  29.1 
 
 
189 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00227194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2737  hypothetical protein  21.77 
 
 
190 aa  41.2  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000335413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>