47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3589 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3589  putative proline rich signal peptide protein  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3631  putative proline rich signal peptide protein  51.46 
 
 		 219 aa  215  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0868148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4435  putative proline rich signal peptide protein  59.65 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0592  putative proline rich signal peptide protein  50 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4527  putative proline rich signal peptide protein  51.46 
 
 		 217 aa  191  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0514  putative proline rich signal peptide protein  47.72 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2267  putative proline rich signal peptide protein  50.58 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3242  hypothetical protein  45.51 
 
 		 197 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3893  hypothetical protein  44.94 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.994478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0273  hypothetical protein  43.58 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440817  decreased coverage  0.00233416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4002  hypothetical protein  42.77 
 
 		 189 aa  131  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000676409 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2076  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  33.71 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1774  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  36.08 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.585717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0076  proline rich signal peptide protein  33.87 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0426414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3404  proline rich signal peptide protein  33.74 
 
 		 291 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3350  proline rich signal peptide protein  33.33 
 
 		 256 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3673  putative proline rich signal peptide protein  33.33 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0029  proline rich signal peptide protein  35.62 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3561  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  33.54 
 
 		 276 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4085  hypothetical protein  34.12 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3119  hypothetical protein  30.77 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.924603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4411  hypothetical protein  29.57 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0391  proline rich signal peptide protein  34.39 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6473  hypothetical protein  30.41 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2358  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0147  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.583084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0040  hypothetical protein  29.41 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0351  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0166  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0156  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2280  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2800  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2508  hypothetical protein  30.41 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3138  hypothetical protein  30.41 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3122  hypothetical protein  30.41 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0314  hypothetical protein  29.03 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0133  hypothetical protein  30.46 
 
 		 196 aa  95.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3177  hypothetical protein  31.79 
 
 		 197 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3060  hypothetical protein  31.79 
 
 		 197 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0017  proline rich signal peptide protein  32.6 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0183  putative proline rich signal peptide protein  26.99 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000332053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2625  hypothetical protein  27.32 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0190  hypothetical protein  25.13 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0198  hypothetical protein  24.34 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2082  hypothetical protein  21.08 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2846  hypothetical protein  22.38 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3017  hypothetical protein  23.7 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>