46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2082 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2082  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2625  hypothetical protein  32.11 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0183  putative proline rich signal peptide protein  33.52 
 
 		 179 aa  87.8  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000332053 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0017  proline rich signal peptide protein  31.21 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2846  hypothetical protein  31.69 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3017  hypothetical protein  32.3 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0198  hypothetical protein  30.72 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4085  hypothetical protein  28.08 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0029  proline rich signal peptide protein  27.96 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0076  proline rich signal peptide protein  28.57 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0426414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3673  putative proline rich signal peptide protein  30.11 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0391  proline rich signal peptide protein  26 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4411  hypothetical protein  27.17 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3350  proline rich signal peptide protein  29.17 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3119  hypothetical protein  28.8 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.924603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0314  hypothetical protein  27.17 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2076  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  25.14 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0514  putative proline rich signal peptide protein  28 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2508  hypothetical protein  27.72 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3122  hypothetical protein  27.72 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3138  hypothetical protein  27.72 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3561  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  26.63 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6473  hypothetical protein  27.17 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0040  hypothetical protein  26.04 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3404  proline rich signal peptide protein  25.95 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0190  hypothetical protein  23.78 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1774  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  22.94 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.585717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0133  hypothetical protein  25.54 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3177  hypothetical protein  26.22 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3060  hypothetical protein  26.22 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2800  hypothetical protein  25.54 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2358  hypothetical protein  25.54 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0166  hypothetical protein  25.54 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0156  hypothetical protein  25.54 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2280  hypothetical protein  25.54 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0351  hypothetical protein  25.54 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0147  hypothetical protein  25.54 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.583084  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3893  hypothetical protein  25.45 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.994478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3242  hypothetical protein  24.85 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3631  putative proline rich signal peptide protein  23.81 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0868148 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2270  conserved hypothetical protein, proline rich; putative membrane anchored protein  25 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4002  hypothetical protein  25.5 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000676409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3589  putative proline rich signal peptide protein  21.08 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03554  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0273  hypothetical protein  21.98 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440817  decreased coverage  0.00233416 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4527  putative proline rich signal peptide protein  23.61 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2267  putative proline rich signal peptide protein  20.45 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>