74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3351 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3351  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  33.78 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  34.16 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  30.25 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  30.83 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0422  protein of unknown function DUF88  32.52 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000507948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  31.72 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  26.75 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  29.63 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  26.75 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  30.2 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  37.23 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  29.55 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0169  hypothetical protein  30.66 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.654892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  29.92 
 
 		 419 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  26.49 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  24.89 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  25.43 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  31.97 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  24.17 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  24.12 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  25.1 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  24.43 
 
 		 236 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  32.65 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  28.66 
 
 		 381 aa  49.3  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  24.67 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  25.73 
 
 		 472 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  28.66 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  41.18 
 
 		 600 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  26.83 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  25.73 
 
 		 483 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  25.73 
 
 		 483 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  29.37 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  27.4 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  24.68 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  25.95 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  25.9 
 
 		 496 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  27.54 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  24.26 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  23.83 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  29.51 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  29.23 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  28.57 
 
 		 335 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  25.9 
 
 		 498 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  25.88 
 
 		 440 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  29.73 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  25.9 
 
 		 498 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  25.9 
 
 		 498 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  28.46 
 
 		 564 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  33.67 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  25.9 
 
 		 508 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  26.06 
 
 		 501 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0356  hypothetical protein  29.09 
 
 		 160 aa  45.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198586 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  32.05 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  31.63 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  24.77 
 
 		 264 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  26.06 
 
 		 507 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  28.91 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  28.91 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  28.46 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  26.32 
 
 		 480 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  26.32 
 
 		 478 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  34.67 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  28.77 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  35.82 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  25.77 
 
 		 477 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  35.82 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  29.69 
 
 		 421 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  34.33 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  29.13 
 
 		 842 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  40.82 
 
 		 787 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  28.23 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>