53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3046 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3046  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
495 aa  975    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.742448  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2433  TPR repeat-containing protein  71.23 
 
 
497 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000860113  decreased coverage  0.000244863 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
1297 aa  50.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.22 
 
 
810 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
878 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  28.5 
 
 
729 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  41.46 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
352 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  38.81 
 
 
291 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
388 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  33.8 
 
 
377 aa  47  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  41.03 
 
 
400 aa  47  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 
279 aa  47  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0009  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
267 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
654 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  41.1 
 
 
310 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  41.1 
 
 
310 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  42.47 
 
 
325 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.37 
 
 
784 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
566 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1904  chaperone protein DnaJ  43.28 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  40.79 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.3 
 
 
334 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00171  chaperone protein DnaJ  39.73 
 
 
377 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0387416 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03160  chaperone regulator, putative  36.14 
 
 
498 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 
767 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 
4079 aa  44.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.79 
 
 
324 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
372 aa  44.7  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2999  chaperone protein DnaJ  33.85 
 
 
395 aa  44.3  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905644  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
280 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  39.44 
 
 
386 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00059  cell cycle control protein (Cwf23), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12440)  35.62 
 
 
435 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00211  chaperone protein DnaJ  40.91 
 
 
378 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  37.65 
 
 
375 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
583 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 
435 aa  43.9  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 
212 aa  43.9  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  34.38 
 
 
373 aa  43.9  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
621 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0020  chaperone protein DnaJ  39.39 
 
 
376 aa  43.5  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0017  chaperone protein DnaJ  40.91 
 
 
374 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.629489  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00161  chaperone protein DnaJ  40.91 
 
 
374 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.453934  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  25.85 
 
 
545 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2928  chaperone protein DnaJ  39.39 
 
 
375 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  23.98 
 
 
564 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3191  chaperone protein DnaJ  39.39 
 
 
375 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.56 
 
 
458 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36016  predicted protein  32.86 
 
 
455 aa  43.5  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.941412  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  35.38 
 
 
380 aa  43.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1571  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.94 
 
 
348 aa  43.5  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.090123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>