89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3209 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3209  ABC cobalt transporter, inner membrane subunit, CbiQ  100 
 
 		 236 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918003  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3949  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  99.15 
 
 		 236 aa  427  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1367  cobalt ABC transporter, permease protein  43.78 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1323  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  43.78 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  41.38 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1961  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  35.93 
 
 		 261 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  36.8 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1949  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  41.57 
 
 		 267 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1348  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.34 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.094753  hitchhiker  0.0000174719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2634  cobalt transport protein  40.91 
 
 		 315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2095  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  34.09 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0329891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1131  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2020  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  35.33 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160433  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3434  hypothetical protein  44.44 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.971737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  36.36 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3138  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  37.97 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1473  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  36.97 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1937  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  38.42 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.118401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1192  cobalt ABC transporter, permease protein, putative  37.25 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00889776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.48 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  35.75 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1329  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.73 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2186  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.22 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00517893 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0578  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.84 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.852275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4361  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.67 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1042  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.73 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.196443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.56 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0173  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit, putative  23.15 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0514  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  34.87 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.150411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4017  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.23 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2781  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.95 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115944  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1368  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.59 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.744959  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2565  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.59 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000511957  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0491  cobalt transport protein  31.94 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.641356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.99 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0774  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.82 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5177  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.9 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0541  putative cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  16.78 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2006  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.97 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0118677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1353  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.53 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0745  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.82 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4295  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.1 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.890786  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1754  cobalt transport protein  34.83 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0819489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1058  cobalt transport protein  26 
 
 		 311 aa  52  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0296  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  38.24 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.149424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1571  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  29.59 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2440  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  33.77 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  23.17 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0994  cobalt ABC transporter, permease protein  31.97 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1118  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.43 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1008  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.43 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0328725  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2761  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.33 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1183  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.87 
 
 		 265 aa  48.9  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.239886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1280  cobalt ABC transporter, permease protein  37 
 
 		 270 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15388  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2563  cobalt transport protein  22.22 
 
 		 293 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.121483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.13 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.53 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0781  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.16 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1199  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.84 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00978481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0091  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.41 
 
 		 310 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1640  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.45 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000368028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2003  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  39.08 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.1214e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1802  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.71 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113984  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1405  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.32 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.946346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1268  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.43 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.28 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000100413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4180  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.1 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2331  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.39 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.65 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3207  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  23.42 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  36.09 
 
 		 270 aa  45.1  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000240215  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2133  cobalt transport protein, putative  29.73 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1961  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.43 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.688465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0691  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.12 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4056  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.08 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1046  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.03 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4721  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.94 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2293  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.25 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  37.43 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0485  cobalt transport protein  30.56 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1779  cobalt transport protein  29.52 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.719291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11100  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.86 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108743  normal  0.024314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1535  cobalt transport protein  31.71 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  23.35 
 
 		 291 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  23.35 
 
 		 291 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2048  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.87 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2111  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.87 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal  0.0223039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2065  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  29.87 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0206381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  29.01 
 
 		 275 aa  42  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>