69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2133 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2133  cobalt transport protein, putative  100 
 
 		 264 aa  530  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0034  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.54 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0846524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2471  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.49 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0134  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.42 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.298184  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2020  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.43 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160433  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1405  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.33 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.946346  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.43 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.55 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0088  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.97 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0694  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.32 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0473101  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1769  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.67 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.344315  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1368  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.41 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.744959  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2634  cobalt transport protein  26.06 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.5 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2565  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.57 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000511957  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  31.97 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1390  excinuclease ABC subunit C  24.22 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4017  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.62 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4295  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.42 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.890786  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1199  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.35 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00978481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0745  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.5 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2781  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.62 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115944  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.09 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000240215  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0296  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.57 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.149424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0774  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.5 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2003  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.7 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.1214e-25 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.03 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3434  hypothetical protein  24.75 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.971737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1961  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  27.03 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1323  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  23.73 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1571  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  25.13 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1367  cobalt ABC transporter, permease protein  23.73 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.74 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1353  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.25 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1637  cobalt transport protein  27.66 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.125207  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0187  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  23.97 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0184  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  23.97 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1008  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.06 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0328725  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2095  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  20.45 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0329891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.09 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1220  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  23.44 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2761  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.07 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1348  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.76 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.094753  hitchhiker  0.0000174719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.85 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1046  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.86 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1191  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.83 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0514  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  28.12 
 
 		 252 aa  45.4  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.150411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1802  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.66 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1477  cobalt transport protein  24.58 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11100  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  21.76 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108743  normal  0.024314 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  30 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1795  cobalt ABC transporter CbiQ, inner membrane subunit  23.53 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1268  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.97 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2331  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.42 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3209  ABC cobalt transporter, inner membrane subunit, CbiQ  29.73 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918003  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1118  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.07 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4056  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.25 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.47 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3949  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.73 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  28.75 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1058  cobalt transport protein  26.09 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0095  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.38 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1765  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.68 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00054388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0691  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.7 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2186  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.3 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00517893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1280  cobalt ABC transporter, permease protein  20.75 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15388  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1779  cobalt transport protein  27.16 
 
 		 216 aa  42.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.719291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1131  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.58 
 
 		 246 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  19.88 
 
 		 270 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000100413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>