32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11100 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11100  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  100 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108743  normal  0.024314 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0883  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.29 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0331  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.23 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1961  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.46 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.688465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0190  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.11 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000816865  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1368  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.35 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.744959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1802  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.56 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1765  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.03 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00054388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1183  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.62 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.239886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.77 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.91 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.46 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0691  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.36 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4361  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.59 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1058  cobalt transport protein  20.28 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1862  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  32.74 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.144825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0491  cobalt transport protein  26.42 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.641356  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.84 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3890  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.09 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2133  cobalt transport protein, putative  21.76 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1199  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.81 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00978481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1390  excinuclease ABC subunit C  28.21 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3002  cobalt ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.03 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000100413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.26 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2565  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.66 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000511957  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1859  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.45 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2006  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.42 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0118677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2440  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  26.98 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2563  cobalt transport protein  26.28 
 
 		 293 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.121483 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3207  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  25.45 
 
 		 259 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1640  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.66 
 
 		 313 aa  42  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000368028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>