22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0331 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0331  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  100 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11100  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.23 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108743  normal  0.024314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.59 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.64 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0491  cobalt transport protein  33.05 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.641356  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0541  putative cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  29.51 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4361  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.21 
 
 
269 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1046  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.91 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1390  excinuclease ABC subunit C  25.86 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1862  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  26.21 
 
 
314 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.144825  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0883  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.71 
 
 
279 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2565  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.03 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000511957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2634  cobalt transport protein  26.04 
 
 
315 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4017  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.34 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3207  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  25.36 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1765  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.63 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00054388  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0745  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.4 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3138  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.13 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1802  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.91 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113984  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0774  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.8 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.97 
 
 
265 aa  42  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2186  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.17 
 
 
260 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00517893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>