38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0541 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0541  putative cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  100 
 
 		 216 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0173  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit, putative  39.22 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0555  hypothetical protein  36.68 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.257159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1937  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.17 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.118401 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1348  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.81 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.094753  hitchhiker  0.0000174719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2634  cobalt transport protein  26.72 
 
 		 315 aa  71.6  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.89 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2095  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  25.44 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0329891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3434  hypothetical protein  29.07 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.971737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1131  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.5 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2020  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.24 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160433  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1192  cobalt ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00889776  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3138  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.21 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1949  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  23.53 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1961  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  24.78 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1367  cobalt ABC transporter, permease protein  21.37 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1323  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  21.05 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  20.3 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.62 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2471  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.48 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  20.34 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3949  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.24 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3209  ABC cobalt transporter, inner membrane subunit, CbiQ  24.24 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918003  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0331  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  32.67 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.88 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000240215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2761  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.93 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2003  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.5 
 
 		 270 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.1214e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4361  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25 
 
 		 269 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2440  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  27.27 
 
 		 270 aa  48.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1280  cobalt ABC transporter, permease protein  26.97 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.9 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1571  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  25.66 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0514  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  27.78 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.150411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1473  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.01 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2565  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.77 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000511957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  26.09 
 
 		 267 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1329  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.19 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  22.4 
 
 		 269 aa  42  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>