31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0173 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0173  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit, putative  100 
 
 		 217 aa  421  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0555  hypothetical protein  52.56 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.257159  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0541  putative cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  39.22 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1961  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  29.92 
 
 		 261 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2020  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.71 
 
 		 252 aa  86.3  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.14 
 
 		 255 aa  85.9  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1192  cobalt ABC transporter, permease protein, putative  27.21 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00889776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2095  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  27.05 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0329891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1949  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  26.02 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1348  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.7 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.094753  hitchhiker  0.0000174719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.7 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2634  cobalt transport protein  26.05 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1323  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  26.79 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1367  cobalt ABC transporter, permease protein  26.79 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3138  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.95 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.32 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1473  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.97 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3434  hypothetical protein  28.26 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.971737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1131  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.55 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.355276 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1937  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.32 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.118401 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2471  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.86 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3209  ABC cobalt transporter, inner membrane subunit, CbiQ  24.49 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918003  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3949  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.49 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.63 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.41 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.71 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4361  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.69 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2565  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.09 
 
 		 268 aa  45.1  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000511957  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0491  cobalt transport protein  22.22 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.641356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.08 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000100413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2293  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.92 
 
 		 259 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>