More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4212 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4212  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 320 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.630701  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4007  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848988  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  35.97 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 		 341 aa  192  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  35.43 
 
 		 367 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 		 319 aa  188  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  34.74 
 
 		 330 aa  185  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  34.74 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.23 
 
 		 319 aa  182  7e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.5 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.5 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.19 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  29.5 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.5 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  33 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  33.54 
 
 		 320 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  31.68 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.52 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  32.48 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  33.55 
 
 		 373 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  33.55 
 
 		 373 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  32.17 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  31.83 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  30.89 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 		 347 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  31.72 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  31.83 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.48 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.48 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.48 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 347 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2381  glycosyltransferase, group 2 family protein  32.13 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 		 383 aa  158  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  29.97 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 		 334 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  32.57 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  29.52 
 
 		 353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4683  Ribonuclease III  30.32 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.518528  normal  0.796343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  30.13 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0340  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.534291  normal  0.0701181 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2497  glycosyl transferase family 2  30.79 
 
 		 351 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00316159  normal  0.514307 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1144  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000527069  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.53 
 
 		 308 aa  149  8e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  30.67 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  31.58 
 
 		 324 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0642  putative glycosyl transferase  29.11 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  29.22 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  28.71 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  30.75 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  29.32 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2086  glycosyltransferase  31.07 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  29.03 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0236  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.855087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 331 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  28.99 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 		 664 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0048  ribonuclease III  30.16 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.650268  hitchhiker  0.000105467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  30.59 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>