More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4007 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4007  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
327 aa  666    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848988  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  42.26 
 
 
364 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 
366 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  40.66 
 
 
330 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  40.86 
 
 
330 aa  231  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  39.55 
 
 
321 aa  229  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  41.37 
 
 
311 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  41.37 
 
 
311 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  39.56 
 
 
319 aa  225  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 
333 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  38.98 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.81 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  35.81 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  35.48 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.81 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  35.81 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 
320 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  37.03 
 
 
309 aa  216  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  36.98 
 
 
310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
307 aa  215  7e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  38.51 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0340  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.534291  normal  0.0701181 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  38.02 
 
 
347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 
339 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2285  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 
323 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
340 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  38.64 
 
 
332 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 
322 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2789  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
312 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.959212  normal  0.28387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3328  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
312 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
340 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  36.83 
 
 
343 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 
319 aa  209  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  38.83 
 
 
334 aa  209  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  38.83 
 
 
320 aa  209  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  38.31 
 
 
357 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 
331 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 
347 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  37.85 
 
 
330 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  37.01 
 
 
353 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1144  glycosyl transferase family 2  33.23 
 
 
362 aa  206  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000527069  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  37.66 
 
 
347 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  37.85 
 
 
330 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 
334 aa  206  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 
312 aa  206  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 
335 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2849  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 
332 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  37.06 
 
 
336 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  36.77 
 
 
383 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  36.6 
 
 
319 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  36.71 
 
 
339 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.69 
 
 
353 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  35.44 
 
 
319 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.69 
 
 
353 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
312 aa  203  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.69 
 
 
353 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
348 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  36.36 
 
 
365 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  36.84 
 
 
312 aa  202  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  35.99 
 
 
327 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  34.85 
 
 
350 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
365 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
365 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0613  glycosyl transferase family protein  37.54 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.258074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  37.22 
 
 
337 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  34.7 
 
 
367 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 
360 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  36.75 
 
 
312 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  34.74 
 
 
319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  37.58 
 
 
358 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
356 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 
350 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
358 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
339 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
312 aa  192  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 
335 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.92 
 
 
319 aa  191  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  36.01 
 
 
359 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4212  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 
320 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.630701  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  33.66 
 
 
324 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4081  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
319 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.869722  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
324 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4683  Ribonuclease III  36.66 
 
 
314 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.518528  normal  0.796343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 
373 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  33.87 
 
 
373 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  31.19 
 
 
346 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  35.08 
 
 
319 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10440  glycosyl transferase  32.92 
 
 
356 aa  186  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0236  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 
308 aa  186  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.855087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
664 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  34.94 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>