More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0236 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0236  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
308 aa  629  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.855087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  46.69 
 
 
331 aa  295  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  45.1 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.44 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  44.44 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  44.12 
 
 
323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  44.44 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.44 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  43.14 
 
 
333 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  44.7 
 
 
320 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  42.62 
 
 
310 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 
319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  42.67 
 
 
312 aa  268  7e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  43.28 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  41.64 
 
 
322 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 
364 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  41.42 
 
 
341 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  43 
 
 
312 aa  259  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  40.13 
 
 
311 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  40.13 
 
 
311 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  39.8 
 
 
320 aa  258  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  39.8 
 
 
334 aa  258  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.86 
 
 
319 aa  258  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  40.92 
 
 
330 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  41.25 
 
 
330 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  38.82 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  38.03 
 
 
319 aa  253  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  41.37 
 
 
312 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  38.82 
 
 
347 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
366 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  42.72 
 
 
308 aa  251  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.35 
 
 
308 aa  249  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  40.73 
 
 
336 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  38.03 
 
 
321 aa  248  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 
312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  39.35 
 
 
319 aa  242  5e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 
330 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  40 
 
 
308 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  41.37 
 
 
312 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  38.71 
 
 
319 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  39.67 
 
 
308 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  40.26 
 
 
330 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  39.67 
 
 
308 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  36.72 
 
 
348 aa  238  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 
335 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4081  glycosyl transferase family protein  40.07 
 
 
319 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.869722  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  39.14 
 
 
310 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 
340 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  38.89 
 
 
306 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  39.14 
 
 
310 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 
327 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  39.02 
 
 
306 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  38.69 
 
 
306 aa  235  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  38.69 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0613  glycosyl transferase family protein  38.44 
 
 
332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.258074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  38.69 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  38.44 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 
350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  38.61 
 
 
367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0299  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  36.66 
 
 
353 aa  232  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  37.83 
 
 
319 aa  231  9e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  36.51 
 
 
358 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
338 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1376  glycosyl transferase family protein  40.84 
 
 
309 aa  230  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0850607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0728  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
327 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0744  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
327 aa  229  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  38.96 
 
 
312 aa  229  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
365 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
358 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
365 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  37.87 
 
 
356 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  35.53 
 
 
365 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 
359 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1582  glycosyl transferase family 2  37.93 
 
 
314 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.01 
 
 
353 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  36.39 
 
 
342 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.01 
 
 
353 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.01 
 
 
353 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
334 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.97 
 
 
332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1526  glycosyl transferase family 2  38.82 
 
 
334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 
339 aa  225  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1679  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 
347 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  36.96 
 
 
387 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2086  glycosyltransferase  43.69 
 
 
310 aa  223  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0387  Ribonuclease III  37.99 
 
 
315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
340 aa  221  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  37.5 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  39.34 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0363  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.71 
 
 
368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
383 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1941  Ribonuclease III  40.07 
 
 
343 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  34.65 
 
 
337 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>