More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2285 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2285  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
323 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2789  glycosyl transferase family 2  56.35 
 
 
312 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.959212  normal  0.28387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3328  glycosyl transferase family 2  56.35 
 
 
312 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2849  glycosyl transferase family protein  55.02 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0340  glycosyl transferase family 2  52.12 
 
 
314 aa  354  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.534291  normal  0.0701181 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10440  glycosyl transferase  47.13 
 
 
356 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1144  glycosyl transferase family 2  43.91 
 
 
362 aa  297  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000527069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1143  glycosyl transferase family 2  45.66 
 
 
312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0240077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4007  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 
327 aa  211  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848988  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  36.57 
 
 
311 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  36.57 
 
 
311 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 
364 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  30.32 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  33.33 
 
 
308 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  34.9 
 
 
312 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  33.56 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  33.11 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  34.06 
 
 
339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  31.07 
 
 
319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  33.22 
 
 
310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  33.01 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  32.68 
 
 
306 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28271  hypothetical protein  34.28 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.190353 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  32.69 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  32.89 
 
 
330 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  33.22 
 
 
330 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
333 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
336 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 
350 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 
359 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
320 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  34.65 
 
 
319 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 
339 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  33.99 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
310 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  32.55 
 
 
367 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  31.99 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4081  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.869722  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  31.25 
 
 
365 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 
312 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
664 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  33.33 
 
 
343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
357 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.55 
 
 
323 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.6 
 
 
332 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.87 
 
 
323 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.87 
 
 
323 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  33.55 
 
 
319 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.87 
 
 
323 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  29.87 
 
 
323 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
365 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
335 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
330 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
365 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  34.1 
 
 
358 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  30.75 
 
 
332 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
330 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
320 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  31.83 
 
 
347 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0642  putative glycosyl transferase  31.8 
 
 
304 aa  160  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  34.1 
 
 
358 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
339 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
331 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  30.2 
 
 
306 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  32.69 
 
 
353 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
319 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
340 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
340 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 
342 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  32.21 
 
 
337 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 
338 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
334 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  31.46 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
347 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
347 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
347 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.36 
 
 
353 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.36 
 
 
353 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.36 
 
 
353 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
319 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 
309 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  29.04 
 
 
312 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
312 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  32.33 
 
 
348 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
383 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
334 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0236  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.855087  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1582  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
314 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1606  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
324 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 
335 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
387 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
312 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0613  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
332 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.258074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>