166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4022 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  84.85 
 
 		 165 aa  287  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  68.35 
 
 		 162 aa  224  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  61.73 
 
 		 166 aa  214  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  62.11 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  64.47 
 
 		 175 aa  208  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  60.87 
 
 		 163 aa  207  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  59.63 
 
 		 165 aa  204  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  58.02 
 
 		 164 aa  197  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  57.96 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  57.96 
 
 		 164 aa  190  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  56.69 
 
 		 164 aa  187  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  59.21 
 
 		 164 aa  185  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  56.1 
 
 		 169 aa  183  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  53.16 
 
 		 166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  52.23 
 
 		 164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  52.53 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  50.62 
 
 		 175 aa  174  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  50.96 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  50.96 
 
 		 164 aa  174  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  51.85 
 
 		 163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  52.53 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  52.53 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  50.32 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  52.63 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2745  hypothetical protein  51.85 
 
 		 163 aa  167  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390999  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  50.3 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  49.34 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3412  hypothetical protein  45.06 
 
 		 164 aa  155  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4011  protein of unknown function DUF427  50.94 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2920  protein of unknown function DUF427  48.47 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000166616  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  48.97 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0497  protein of unknown function DUF427  46.67 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1034  hypothetical protein  42.95 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0173454  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1757  hypothetical protein  41.89 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.860278  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  42.34 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  42.28 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  42.28 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  43.86 
 
 		 274 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  43.24 
 
 		 125 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  42.86 
 
 		 270 aa  100  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  43.27 
 
 		 130 aa  98.2  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  44.64 
 
 		 125 aa  97.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  43.93 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  94  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  42.2 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  40.57 
 
 		 118 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  40.57 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  40.37 
 
 		 121 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  42.45 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  40.2 
 
 		 125 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  39.82 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  39.81 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  38.18 
 
 		 213 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  42.27 
 
 		 130 aa  88.6  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  39.62 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  37.39 
 
 		 126 aa  87.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  40.4 
 
 		 130 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  37.27 
 
 		 124 aa  87  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  38.53 
 
 		 135 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  37.96 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  39.45 
 
 		 126 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  39.25 
 
 		 241 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  37.74 
 
 		 265 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  44.79 
 
 		 120 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  37.69 
 
 		 249 aa  84.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  38.18 
 
 		 225 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  38.18 
 
 		 241 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  40.91 
 
 		 120 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2252  hypothetical protein  39.6 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  36.79 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  40.19 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  35 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  38.38 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  42.35 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2004  hypothetical protein  38.18 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2614  hypothetical protein  38.18 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.899878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2643  hypothetical protein  38.18 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2534  hypothetical protein  40.19 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975897  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  37.38 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0684  hypothetical protein  37.27 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.835024  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  34.31 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  39.18 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  35.79 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  31.78 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  34.26 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  30.84 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  30.84 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  36.67 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0677  hypothetical protein  37.04 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782308  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11074  hypothetical protein  36.13 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0277375  normal  0.0429341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  36.11 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4092  hypothetical protein  38 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681938  normal  0.58823 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>