159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3415 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  99.26 
 
 		 135 aa  273  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  80.74 
 
 		 135 aa  230  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  90.3 
 
 		 135 aa  227  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  90.3 
 
 		 135 aa  227  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  89.55 
 
 		 135 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  80.74 
 
 		 135 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  72.95 
 
 		 127 aa  192  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  68.85 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  69.17 
 
 		 125 aa  184  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  70.83 
 
 		 132 aa  181  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  70.25 
 
 		 125 aa  180  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  70.83 
 
 		 132 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  68.33 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  69.35 
 
 		 125 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  66.39 
 
 		 241 aa  166  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  64.46 
 
 		 241 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  64.46 
 
 		 225 aa  166  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  62.18 
 
 		 213 aa  160  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  61.86 
 
 		 125 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  59.17 
 
 		 120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  58.47 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  60.17 
 
 		 120 aa  148  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  57.63 
 
 		 121 aa  146  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  56.56 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  57.5 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  57.52 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  57.52 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  55.83 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  55.56 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  55.56 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  56.64 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  54.7 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  56.9 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  52.59 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  52.21 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  50.43 
 
 		 123 aa  121  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  50.43 
 
 		 123 aa  121  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  50.43 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  52.54 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  52.85 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  50.44 
 
 		 124 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  55.17 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  42.11 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  44.04 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  44.74 
 
 		 274 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  38.71 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  40.65 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0640  hypothetical protein  46.53 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  43.52 
 
 		 165 aa  97.1  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  43.52 
 
 		 165 aa  97.1  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  40.68 
 
 		 270 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  41.67 
 
 		 165 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  39.32 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  41.12 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  39.47 
 
 		 265 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  41.35 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  39.25 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  38.21 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  39.81 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  36.45 
 
 		 166 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0677  hypothetical protein  39.13 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782308  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  37.14 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  39.25 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  35.78 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1974  hypothetical protein  34.29 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0682  hypothetical protein  34.29 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11076  DUF427 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02220)  40.2 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  40.82 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  34.26 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  35.51 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0684  hypothetical protein  35.04 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.835024  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  34.19 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2643  hypothetical protein  34.19 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2004  hypothetical protein  34.19 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2614  hypothetical protein  34.19 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.899878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1015  hypothetical protein  37.61 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  32.41 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0607  hypothetical protein  37.61 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2441  hypothetical protein  37.61 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0855  hypothetical protein  37.61 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.545031  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0055  hypothetical protein  37.61 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  31.62 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0850  hypothetical protein  37.61 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2534  hypothetical protein  34.19 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975897  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0198  hypothetical protein  36.36 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.057512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  29.09 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0175  protein of unknown function DUF427  35.4 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  33.03 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2252  hypothetical protein  34.19 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  32.52 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  34.83 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1748  hypothetical protein  39.39 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.803353  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5108  hypothetical protein  36.94 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5196  hypothetical protein  36.94 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  32.77 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5487  hypothetical protein  36.94 
 
 		 268 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2009  hypothetical protein  34.95 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.147252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>