162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2211 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  324  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  59.35 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  53.8 
 
 		 175 aa  177  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  54.61 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  51.32 
 
 		 166 aa  170  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  53.29 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  52.63 
 
 		 165 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  53.29 
 
 		 165 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  52.63 
 
 		 162 aa  167  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  55.92 
 
 		 164 aa  166  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  51.97 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  54.61 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  48.68 
 
 		 164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  55.26 
 
 		 169 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  50 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  50 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  53.95 
 
 		 164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  47.37 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  53.95 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  46.71 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  49.34 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3412  hypothetical protein  44.74 
 
 		 164 aa  144  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2745  hypothetical protein  48.03 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390999  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  48.03 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  47.37 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  49.34 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  49.34 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  49.34 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  46.71 
 
 		 163 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  48.03 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4011  protein of unknown function DUF427  44.65 
 
 		 160 aa  123  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0497  protein of unknown function DUF427  48.73 
 
 		 185 aa  120  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1757  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.860278  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1034  hypothetical protein  38 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0173454  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2920  protein of unknown function DUF427  44.65 
 
 		 175 aa  117  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000166616  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  41.12 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  40.19 
 
 		 118 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  36.89 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  38.32 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  37.96 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  34.15 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  36.11 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  35.42 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  35.24 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  31.45 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  33.02 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  31.78 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  31.78 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13333  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.430926  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  34.02 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  33.83 
 
 		 274 aa  67.8  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  31.78 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  31.96 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  30.69 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  35.56 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  34.55 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0677  hypothetical protein  33.01 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  37.78 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  32 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  28.83 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  31.48 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11687  hypothetical protein  37.23 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4960  protein of unknown function DUF427  36.26 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0367366  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  31.96 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  37.63 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  32.99 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  30.17 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  36.11 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  32.99 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  33.71 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1644  hypothetical protein  36.79 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.891055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  30.84 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  31.13 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  29.17 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  29.73 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0684  hypothetical protein  34.69 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.835024  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  31.62 
 
 		 265 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  29.63 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  32.71 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  28.07 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16580  hypothetical protein  32.22 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.286452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  34.58 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1404  protein of unknown function DUF427  31.11 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.944619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5108  hypothetical protein  31.25 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5196  hypothetical protein  31.25 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2534  hypothetical protein  35.51 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975897  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  31.91 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5487  hypothetical protein  31.25 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0837  hypothetical protein  34.07 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.394085  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  28.97 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  34.58 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  28.97 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2564  hypothetical protein  34.44 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.440032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2442  hypothetical protein  31.87 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88433 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2614  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.899878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  31.13 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  29.46 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>