166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3776 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  84.85 
 
 		 165 aa  287  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  68.99 
 
 		 162 aa  230  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  63.98 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  59.76 
 
 		 166 aa  210  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  61.49 
 
 		 165 aa  209  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  61.49 
 
 		 163 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  63.82 
 
 		 175 aa  201  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  54.94 
 
 		 164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  53.09 
 
 		 164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  57.32 
 
 		 169 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  55.06 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  56.33 
 
 		 164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  52.23 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  54.43 
 
 		 164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  50.32 
 
 		 166 aa  176  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  51.59 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  50.96 
 
 		 164 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  57.89 
 
 		 164 aa  174  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  51.85 
 
 		 175 aa  174  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2745  hypothetical protein  53.09 
 
 		 163 aa  173  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390999  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  51.85 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  53.7 
 
 		 163 aa  171  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  53.09 
 
 		 166 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  53.09 
 
 		 166 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  53.29 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  50.3 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  51.32 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3412  hypothetical protein  43.83 
 
 		 164 aa  152  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2920  protein of unknown function DUF427  48.78 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000166616  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4011  protein of unknown function DUF427  49.69 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  46.9 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0497  protein of unknown function DUF427  46.67 
 
 		 185 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1034  hypothetical protein  42.28 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0173454  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1757  hypothetical protein  42.57 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.860278  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  42.28 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  43.24 
 
 		 125 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  40.65 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  42.5 
 
 		 274 aa  99.8  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  40.54 
 
 		 127 aa  99  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  40.5 
 
 		 130 aa  97.8  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  42.06 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  46.88 
 
 		 120 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  40.54 
 
 		 127 aa  94.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  44.34 
 
 		 120 aa  94  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  41.12 
 
 		 125 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  40.54 
 
 		 213 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  42.06 
 
 		 125 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  39.17 
 
 		 270 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  91.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  43.69 
 
 		 120 aa  90.9  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  40.57 
 
 		 124 aa  90.9  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  44.33 
 
 		 125 aa  90.5  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  38.68 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  43.75 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  38.68 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  44.33 
 
 		 135 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  40.54 
 
 		 241 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  40.54 
 
 		 225 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  38.17 
 
 		 249 aa  89  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  40.54 
 
 		 241 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  39.25 
 
 		 135 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  39.25 
 
 		 135 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  43.3 
 
 		 121 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  43.3 
 
 		 121 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  40.62 
 
 		 118 aa  87  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  39.6 
 
 		 135 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  42.71 
 
 		 120 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  44.71 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  44.71 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  44.71 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  34.58 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  38.38 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  33.64 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  33.64 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  35.51 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  32.62 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  39.39 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  41.67 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11074  hypothetical protein  37.6 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0277375  normal  0.0429341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  37.11 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  32.58 
 
 		 265 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  37 
 
 		 264 aa  77  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  35 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  40.7 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4720  hypothetical protein  33.59 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  36.46 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  35.79 
 
 		 122 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2033  hypothetical protein  40.21 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2079  hypothetical protein  40.21 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.601553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  35.29 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  37.11 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  37.08 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  33.64 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  36.45 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  35.56 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2016  hypothetical protein  39.18 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.892245  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2009  hypothetical protein  33.05 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.147252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>