162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2614 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2004  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  244  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2614  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  244  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.899878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2643  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  244  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  93.28 
 
 
119 aa  233  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  89.92 
 
 
119 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2534  hypothetical protein  88.24 
 
 
119 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975897  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0684  hypothetical protein  80.67 
 
 
119 aa  201  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.835024  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0677  hypothetical protein  64.71 
 
 
119 aa  151  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782308  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1015  hypothetical protein  63.64 
 
 
121 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0607  hypothetical protein  63.64 
 
 
121 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2441  hypothetical protein  63.64 
 
 
121 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0850  hypothetical protein  62.81 
 
 
121 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0855  hypothetical protein  63.64 
 
 
121 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.545031  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0055  hypothetical protein  63.64 
 
 
121 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  50.77 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  52.54 
 
 
147 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  50.77 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  42.2 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  40.4 
 
 
121 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  42.73 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  39.29 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  38.74 
 
 
120 aa  88.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  36.84 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  36.7 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0198  hypothetical protein  40.19 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.057512  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  39.39 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  41.49 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  40.4 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  38.18 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  38.68 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  37.61 
 
 
165 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  35.51 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  39.45 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  39.25 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  35.78 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  38.1 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  42.22 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  37.5 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  37.04 
 
 
124 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  35.51 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  38.18 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  39.45 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  42.16 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  39 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  35.51 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  40.59 
 
 
274 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  37.96 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  42.16 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  42.16 
 
 
241 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  37.61 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  37.61 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  32.06 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  40.66 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  34.19 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  34.19 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  37.37 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  36.08 
 
 
265 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  33.96 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  37.38 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  38.32 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  33.63 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  33.63 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  44.44 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  39.08 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  33.64 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4720  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  35.78 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  37.08 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  32.73 
 
 
249 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  33.64 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1974  hypothetical protein  37.5 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  35.19 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0682  hypothetical protein  37.5 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0175  protein of unknown function DUF427  37.07 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  34.19 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  34.19 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  34.19 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13333  hypothetical protein  32.22 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.430926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  34.74 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  33.02 
 
 
264 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  35.63 
 
 
120 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  34.58 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  35.19 
 
 
175 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0640  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  58.9  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2564  hypothetical protein  35.96 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.440032  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1854  hypothetical protein  35.96 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189949  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  33.64 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0315  protein of unknown function DUF427  34.44 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06900  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  25.49 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2009  hypothetical protein  30.48 
 
 
248 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  34.31 
 
 
270 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  27.84 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11074  hypothetical protein  32.38 
 
 
254 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0277375  normal  0.0429341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1404  protein of unknown function DUF427  34.92 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.944619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1659  hypothetical protein  39.68 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>