165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2271 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  549  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  55.85 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  47.35 
 
 		 265 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0175  protein of unknown function DUF427  41.91 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  43.35 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4720  hypothetical protein  39.91 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2009  hypothetical protein  35 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11074  hypothetical protein  38.49 
 
 		 254 aa  146  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0277375  normal  0.0429341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  33.62 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3249  hypothetical protein  35.08 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2252  hypothetical protein  33.99 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  33.47 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4092  hypothetical protein  33.46 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681938  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5108  hypothetical protein  31.62 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5196  hypothetical protein  31.62 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5487  hypothetical protein  31.62 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  44.17 
 
 		 165 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  43.97 
 
 		 166 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2033  hypothetical protein  31.64 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2079  hypothetical protein  31.64 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.601553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  42.5 
 
 		 165 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  42.24 
 
 		 163 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  42.86 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2016  hypothetical protein  31.25 
 
 		 231 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.892245  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  44.55 
 
 		 125 aa  96.3  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  40.68 
 
 		 135 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  41.23 
 
 		 118 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  40.68 
 
 		 135 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  41.67 
 
 		 118 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  39.17 
 
 		 165 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  41.96 
 
 		 175 aa  92.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  40.68 
 
 		 135 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  38.89 
 
 		 121 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  37.27 
 
 		 127 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  39.13 
 
 		 135 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  38.18 
 
 		 125 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  42.34 
 
 		 225 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  42.34 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  39.29 
 
 		 125 aa  85.5  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  42.34 
 
 		 241 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  37.72 
 
 		 118 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  41.12 
 
 		 130 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  40.91 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  39.83 
 
 		 135 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  39.83 
 
 		 135 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  39.83 
 
 		 135 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  39.81 
 
 		 120 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  34.78 
 
 		 127 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  39.82 
 
 		 121 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  40.48 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  35 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  37.17 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  40 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  35.45 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  40.19 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  39.82 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  35.71 
 
 		 166 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  42.06 
 
 		 126 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  37.61 
 
 		 130 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  35.4 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  37.61 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  37.04 
 
 		 120 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  35.78 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  41.82 
 
 		 124 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  38.79 
 
 		 121 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  38.89 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  37.04 
 
 		 120 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  36.28 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  38.32 
 
 		 126 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  37.04 
 
 		 127 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  33.63 
 
 		 122 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  38.35 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  35.65 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  36.97 
 
 		 165 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  34.4 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  34.48 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  33.91 
 
 		 129 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2920  protein of unknown function DUF427  34.65 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000166616  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  34.4 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  36.09 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  36.09 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  36.51 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  31.9 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  36.54 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1745  hypothetical protein  40.66 
 
 		 94 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0354248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  35.4 
 
 		 164 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  36.54 
 
 		 164 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0506  protein of unknown function DUF427  49.28 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107078  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0198  hypothetical protein  36.04 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.057512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1271  hypothetical protein  43.48 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5420  protein of unknown function DUF427  50.72 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0261431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3986  protein of unknown function DUF427  37.78 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000766725 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11076  DUF427 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02220)  35.71 
 
 		 100 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  33.83 
 
 		 163 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>