144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4720 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4720  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11074  hypothetical protein  74.7 
 
 
254 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0277375  normal  0.0429341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  51.23 
 
 
249 aa  238  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  44.76 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  44.05 
 
 
274 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  39.91 
 
 
270 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0175  protein of unknown function DUF427  39.59 
 
 
297 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  36.48 
 
 
265 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3249  hypothetical protein  37.4 
 
 
283 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5487  hypothetical protein  36.78 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304814  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5108  hypothetical protein  36.78 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5196  hypothetical protein  36.78 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  36.93 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2009  hypothetical protein  35.53 
 
 
248 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2252  hypothetical protein  30.83 
 
 
225 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  42.62 
 
 
124 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4092  hypothetical protein  31.67 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681938  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2033  hypothetical protein  35.56 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2079  hypothetical protein  35.56 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.601553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2016  hypothetical protein  34.81 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.892245  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  37.21 
 
 
165 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  40.2 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  41.76 
 
 
130 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  41.9 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  33.59 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  35 
 
 
165 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  39.52 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  33.6 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  32.82 
 
 
175 aa  72  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  33.61 
 
 
130 aa  72  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  31.67 
 
 
166 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  37.7 
 
 
123 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  37.7 
 
 
123 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  43 
 
 
121 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  42 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  32.43 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  36.89 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  36.45 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2004  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2614  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.899878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2643  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  38.39 
 
 
125 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  40.21 
 
 
118 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  37.62 
 
 
127 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  32.77 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  38.78 
 
 
120 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0684  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.835024  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  37.11 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  35.29 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  32.74 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  38 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  42.57 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  42.57 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  32.43 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  38.1 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  37.11 
 
 
127 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2534  hypothetical protein  32.43 
 
 
119 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975897  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  32.8 
 
 
165 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  35.64 
 
 
118 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  38.83 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  35.92 
 
 
120 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  38.83 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  36.27 
 
 
135 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  37.11 
 
 
132 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  37.37 
 
 
135 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  35.29 
 
 
213 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  38.83 
 
 
241 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  35.29 
 
 
125 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  35.05 
 
 
118 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  41.46 
 
 
120 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  36.46 
 
 
113 aa  62.4  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0198  hypothetical protein  41.94 
 
 
116 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.057512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  38.78 
 
 
126 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  40.86 
 
 
124 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  35.05 
 
 
132 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  27.27 
 
 
163 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  35 
 
 
120 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  36.08 
 
 
135 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  34.29 
 
 
122 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  28.21 
 
 
185 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  36.08 
 
 
135 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  32.09 
 
 
166 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  34.13 
 
 
163 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  38.37 
 
 
135 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0677  hypothetical protein  35.16 
 
 
119 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782308  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  26.55 
 
 
164 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  35.29 
 
 
124 aa  55.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  37.21 
 
 
135 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  37.21 
 
 
135 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  30.23 
 
 
166 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  30.23 
 
 
166 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  31.01 
 
 
166 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  26.55 
 
 
164 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  35.96 
 
 
102 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3182  protein of unknown function DUF427  32.95 
 
 
93 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  28.91 
 
 
158 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2920  protein of unknown function DUF427  31.34 
 
 
175 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000166616  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>