162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3161 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  320  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  76.22 
 
 		 164 aa  245  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  76.83 
 
 		 164 aa  244  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  75.61 
 
 		 164 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  69.14 
 
 		 169 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  64.15 
 
 		 163 aa  206  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  58.9 
 
 		 165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  58.02 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  60.49 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  60.49 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  59.26 
 
 		 166 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  55.49 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  53.66 
 
 		 164 aa  190  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  53.66 
 
 		 164 aa  190  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  57.86 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  58.02 
 
 		 175 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  56.79 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  52.12 
 
 		 164 aa  180  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  52.44 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  50.61 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  56.25 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  57.14 
 
 		 162 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  56.58 
 
 		 175 aa  173  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  54.61 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2745  hypothetical protein  53.7 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390999  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3412  hypothetical protein  48.48 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  54.32 
 
 		 163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  49.38 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  48.68 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2920  protein of unknown function DUF427  50.6 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000166616  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4011  protein of unknown function DUF427  50.31 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  47.3 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0497  protein of unknown function DUF427  54.6 
 
 		 185 aa  138  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1034  hypothetical protein  40.13 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0173454  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1757  hypothetical protein  43.05 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.860278  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  40.52 
 
 		 274 aa  81.3  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  36.27 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  34.48 
 
 		 270 aa  70.9  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  36.45 
 
 		 124 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  32.43 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  31.53 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  32.52 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  37.89 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  36.63 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  36.63 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  45.68 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  32.06 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  35.48 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  30.53 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  32.41 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  31.86 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0506  protein of unknown function DUF427  38.89 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107078  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  32.79 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4960  protein of unknown function DUF427  42.67 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0367366  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  34.31 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  38.3 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2564  hypothetical protein  38.89 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.440032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  35.29 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  33.67 
 
 		 130 aa  62  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0315  protein of unknown function DUF427  35.48 
 
 		 93 aa  62  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  31.53 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  34.38 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  32.08 
 
 		 265 aa  60.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  32.65 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0837  hypothetical protein  34.41 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.394085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  33.94 
 
 		 119 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  31.63 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  34.31 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  30.56 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  31.86 
 
 		 120 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1854  hypothetical protein  37.78 
 
 		 94 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189949  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  33.7 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  31.37 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13333  hypothetical protein  30.11 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.430926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  31.37 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5420  protein of unknown function DUF427  37.5 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0261431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  36.05 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2442  hypothetical protein  35.23 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  31.37 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  32.67 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1659  hypothetical protein  36 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  28.28 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3182  protein of unknown function DUF427  35.56 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508969 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  31.53 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  29.41 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  31.53 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16580  hypothetical protein  34.09 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.286452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1404  protein of unknown function DUF427  32.22 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.944619 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  31.53 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1644  hypothetical protein  36.17 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.891055  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0006  protein of unknown function DUF427  34.33 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0004  protein of unknown function DUF427  34.33 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  30.61 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  28.21 
 
 		 264 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3292  protein of unknown function DUF427  34.09 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3986  protein of unknown function DUF427  32.22 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000766725 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>