147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2990 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  330  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  330  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  93.98 
 
 
166 aa  313  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2745  hypothetical protein  75.93 
 
 
163 aa  248  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390999  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  74.07 
 
 
163 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  60.84 
 
 
166 aa  203  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  62.58 
 
 
164 aa  201  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  62.58 
 
 
164 aa  200  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  61.35 
 
 
164 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  58.28 
 
 
175 aa  191  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  60.12 
 
 
169 aa  188  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  59.75 
 
 
163 aa  187  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  59.12 
 
 
165 aa  180  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  54.32 
 
 
164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  59.87 
 
 
164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  53.99 
 
 
164 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  54.82 
 
 
166 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  54.72 
 
 
162 aa  173  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4011  protein of unknown function DUF427  54.72 
 
 
160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  52.53 
 
 
165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  55.97 
 
 
165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  53.09 
 
 
165 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  52.15 
 
 
165 aa  167  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  49.69 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  49.4 
 
 
166 aa  163  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  49.69 
 
 
164 aa  163  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  50.66 
 
 
175 aa  154  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  49.66 
 
 
156 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0497  protein of unknown function DUF427  53.05 
 
 
185 aa  145  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2920  protein of unknown function DUF427  52.1 
 
 
175 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000166616  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1757  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.860278  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3412  hypothetical protein  44.17 
 
 
164 aa  137  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  49.34 
 
 
158 aa  137  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  46.71 
 
 
156 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1034  hypothetical protein  43.05 
 
 
158 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0173454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  36.09 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  36.46 
 
 
124 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  32.06 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  35 
 
 
118 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  35 
 
 
118 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 
124 aa  62  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  33.03 
 
 
274 aa  60.5  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  35.96 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  30.08 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2009  hypothetical protein  27.27 
 
 
248 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  28.79 
 
 
265 aa  58.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  29.57 
 
 
127 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  29.9 
 
 
127 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  27.61 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  33.7 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  31.06 
 
 
135 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  29.41 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  34.83 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  23.85 
 
 
517 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  29.41 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  41.18 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  32.29 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  34.83 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  34.83 
 
 
123 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5420  protein of unknown function DUF427  36.36 
 
 
94 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0261431  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  34.83 
 
 
123 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4720  hypothetical protein  30.23 
 
 
258 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11074  hypothetical protein  30.95 
 
 
254 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0277375  normal  0.0429341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2564  hypothetical protein  39.51 
 
 
94 aa  54.3  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.440032  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  33.71 
 
 
118 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  32.56 
 
 
241 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  32.43 
 
 
225 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  30 
 
 
213 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  32.23 
 
 
125 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  32.43 
 
 
241 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  31.46 
 
 
120 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  26.39 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  29.7 
 
 
126 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1854  hypothetical protein  37.04 
 
 
94 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189949  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  32.58 
 
 
120 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0506  protein of unknown function DUF427  40 
 
 
94 aa  50.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107078  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  27.47 
 
 
122 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  29.7 
 
 
265 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  25.62 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  27.41 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  33.64 
 
 
119 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  31 
 
 
264 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13333  hypothetical protein  30.12 
 
 
93 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.430926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  29.21 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  29.13 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  27.73 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  30.34 
 
 
120 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  26.21 
 
 
125 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4960  protein of unknown function DUF427  34.15 
 
 
93 aa  47.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0367366  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5108  hypothetical protein  34.34 
 
 
268 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5196  hypothetical protein  34.34 
 
 
268 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5487  hypothetical protein  34.34 
 
 
268 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304814  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  29.46 
 
 
120 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0315  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 
93 aa  47.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1745  hypothetical protein  35.71 
 
 
94 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0354248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0640  hypothetical protein  27.91 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>