115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4011 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4011  protein of unknown function DUF427  100 
 
 		 160 aa  318  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  54.72 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  54.72 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  55.35 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  55 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  55.62 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  51.25 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  53.46 
 
 		 163 aa  157  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2745  hypothetical protein  54.09 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390999  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  55 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  53.75 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  50.94 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0497  protein of unknown function DUF427  53.37 
 
 		 185 aa  148  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  50 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  52.5 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  50.62 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  49.69 
 
 		 165 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  48.75 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  46.25 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  48.12 
 
 		 164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2920  protein of unknown function DUF427  49.07 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000166616  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  49.69 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  48.12 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  44.38 
 
 		 164 aa  134  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  47.17 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  43.75 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  44.72 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  44.65 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  42.5 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  42.5 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1757  hypothetical protein  44.52 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.860278  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  44.03 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  45.7 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1034  hypothetical protein  39.49 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0173454  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3412  hypothetical protein  38.12 
 
 		 164 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  34.17 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  36.36 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  37.07 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  30.33 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  31.82 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  36.36 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  36.36 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  32.65 
 
 		 118 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  31.19 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  31.03 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  29.46 
 
 		 127 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  30.91 
 
 		 126 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  30.63 
 
 		 118 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  36.45 
 
 		 120 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  26.56 
 
 		 127 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  32.74 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  28.68 
 
 		 270 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  29.79 
 
 		 122 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  31.9 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  33.72 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  29.2 
 
 		 121 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  37.08 
 
 		 102 aa  48.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  28.45 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1974  hypothetical protein  29.09 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0682  hypothetical protein  29.09 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  29.09 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  29.09 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  30.59 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  27.97 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  29.6 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2235  hypothetical protein  41.1 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124766  hitchhiker  0.000411193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1271  hypothetical protein  35.71 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  29.09 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  30.23 
 
 		 249 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5108  hypothetical protein  36.57 
 
 		 268 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  30.83 
 
 		 274 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5196  hypothetical protein  36.57 
 
 		 268 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5487  hypothetical protein  36.57 
 
 		 268 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  30.77 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  29.41 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5420  protein of unknown function DUF427  31.18 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0261431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  30.33 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  30.23 
 
 		 265 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  27.59 
 
 		 132 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  29.13 
 
 		 125 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1644  hypothetical protein  38.81 
 
 		 106 aa  44.3  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.891055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4960  protein of unknown function DUF427  33.71 
 
 		 93 aa  44.3  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0367366  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  32.04 
 
 		 185 aa  43.9  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  30.09 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  30.97 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  27.66 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  27.66 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  30.97 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  30.97 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  29.25 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2033  hypothetical protein  32.08 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  34.96 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2079  hypothetical protein  32.08 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.601553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0175  protein of unknown function DUF427  31.62 
 
 		 297 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  27.66 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0506  protein of unknown function DUF427  35.37 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107078  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>