142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2235 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2235  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  197  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124766  hitchhiker  0.000411193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1271  hypothetical protein  70.65 
 
 
93 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3460  hypothetical protein  72.83 
 
 
93 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.967633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3657  protein of unknown function DUF427  73.12 
 
 
94 aa  147  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1381  hypothetical protein  71.43 
 
 
92 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0029  hypothetical protein  69.23 
 
 
93 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.54022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0315  protein of unknown function DUF427  61.54 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5114  protein of unknown function DUF427  60.87 
 
 
98 aa  125  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1745  hypothetical protein  60.44 
 
 
94 aa  124  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0354248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2662  hypothetical protein  62.64 
 
 
95 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194389  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  54.95 
 
 
102 aa  120  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3986  protein of unknown function DUF427  58.24 
 
 
94 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3292  protein of unknown function DUF427  56.04 
 
 
93 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237584  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0506  protein of unknown function DUF427  55.43 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107078  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3182  protein of unknown function DUF427  54.95 
 
 
93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508969 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0252  hypothetical protein  55.91 
 
 
93 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16580  hypothetical protein  55.56 
 
 
95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.286452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1644  hypothetical protein  54.35 
 
 
106 aa  114  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.891055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2564  hypothetical protein  56.52 
 
 
94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.440032  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1854  hypothetical protein  55.43 
 
 
94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189949  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2442  hypothetical protein  53.76 
 
 
94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.88433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5420  protein of unknown function DUF427  59.55 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0261431  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0965  hypothetical protein  57.78 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1404  protein of unknown function DUF427  51.09 
 
 
94 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.944619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1659  hypothetical protein  54.95 
 
 
93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0111  hypothetical protein  53.85 
 
 
93 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0782  hypothetical protein  52.17 
 
 
92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.060697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0006  protein of unknown function DUF427  53.33 
 
 
94 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0004  protein of unknown function DUF427  53.33 
 
 
94 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13333  hypothetical protein  47.25 
 
 
93 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.430926  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2270  hypothetical protein  55.06 
 
 
94 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4960  protein of unknown function DUF427  53.85 
 
 
93 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0367366  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0837  hypothetical protein  50.55 
 
 
93 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.394085  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1748  hypothetical protein  52.75 
 
 
94 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.803353  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11687  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209291  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0438  hypothetical protein  47.83 
 
 
94 aa  92.8  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3377  hypothetical protein  55.41 
 
 
75 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6918  protein of unknown function DUF427  49.44 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.626573  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06900  conserved hypothetical protein  45.35 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470322  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11076  DUF427 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02220)  42.5 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  37.21 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  35.96 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  37.36 
 
 
127 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  41.27 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  36.26 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  36.05 
 
 
249 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  37.93 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  34.07 
 
 
166 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  37.21 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  41.27 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  32.65 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  32.94 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  39.68 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  39.06 
 
 
274 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  39.68 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  32.97 
 
 
185 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  39.68 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  32.94 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  36.26 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  37.5 
 
 
241 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  36.78 
 
 
113 aa  53.5  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  33.72 
 
 
241 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  33.72 
 
 
225 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  32.56 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  32.56 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  35.94 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  31.87 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  38.1 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  29.59 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  36.67 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  38.1 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  40.3 
 
 
265 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  38.1 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  30.77 
 
 
164 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  32.56 
 
 
123 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  39.13 
 
 
270 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  30.77 
 
 
164 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  37.21 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  29.79 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  30.77 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  31.87 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  33.72 
 
 
264 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  31.18 
 
 
169 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  29.41 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  28.24 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  34.33 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  27.96 
 
 
163 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  29.67 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  32.97 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  35.21 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  30.77 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0640  hypothetical protein  29.03 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  31.87 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  29.67 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
517 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  28.74 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0682  hypothetical protein  34.12 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4092  hypothetical protein  40.32 
 
 
254 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681938  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  28.57 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  32.81 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>