136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2920 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2920  protein of unknown function DUF427  100 
 
 
175 aa  350  7e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000166616  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  55.42 
 
 
166 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  54.82 
 
 
163 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  56.79 
 
 
165 aa  163  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  54.55 
 
 
165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  52.38 
 
 
164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  51.81 
 
 
164 aa  160  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  52.35 
 
 
165 aa  160  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  50.6 
 
 
164 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  50.6 
 
 
164 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  52.98 
 
 
166 aa  155  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  47.31 
 
 
166 aa  154  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  53.01 
 
 
164 aa  154  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  53.01 
 
 
164 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  52.41 
 
 
164 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  48.78 
 
 
165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  50.6 
 
 
175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  51.5 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  51.55 
 
 
169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3412  hypothetical protein  46.67 
 
 
164 aa  144  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  52.1 
 
 
166 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  52.1 
 
 
166 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  50.3 
 
 
162 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  48.47 
 
 
165 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2745  hypothetical protein  52.41 
 
 
163 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390999  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  52.41 
 
 
163 aa  141  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0497  protein of unknown function DUF427  53.01 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4011  protein of unknown function DUF427  49.07 
 
 
160 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  48.73 
 
 
164 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  47.8 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  49.67 
 
 
156 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  44.65 
 
 
158 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1034  hypothetical protein  39.61 
 
 
158 aa  111  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0173454  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  44.3 
 
 
156 aa  110  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1757  hypothetical protein  43.14 
 
 
160 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.860278  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  38.14 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  40.71 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  38.26 
 
 
274 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  34.65 
 
 
270 aa  70.9  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  36.84 
 
 
126 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  41.35 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  32.31 
 
 
130 aa  67  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  36.52 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  39.05 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  35.83 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  38.05 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  36.94 
 
 
264 aa  64.7  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  38.94 
 
 
121 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  34.71 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2009  hypothetical protein  33.58 
 
 
248 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  37.78 
 
 
118 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1974  hypothetical protein  37.21 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0682  hypothetical protein  37.21 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  32.11 
 
 
126 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  35.58 
 
 
124 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  35.79 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  34.44 
 
 
113 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  37.08 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 
127 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  35 
 
 
132 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  38.89 
 
 
120 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  58.9  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  37.36 
 
 
130 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  34.55 
 
 
130 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  39.53 
 
 
118 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2033  hypothetical protein  32.73 
 
 
231 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2079  hypothetical protein  32.73 
 
 
231 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.601553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2534  hypothetical protein  36.84 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975897  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  35.79 
 
 
119 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0677  hypothetical protein  37.37 
 
 
119 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782308  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2004  hypothetical protein  35.79 
 
 
119 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2614  hypothetical protein  35.79 
 
 
119 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.899878  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0684  hypothetical protein  35.79 
 
 
119 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.835024  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2643  hypothetical protein  35.79 
 
 
119 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  32.5 
 
 
213 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  35.87 
 
 
129 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2016  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.892245  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  30.43 
 
 
249 aa  54.7  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  37.78 
 
 
147 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  34.13 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  36.11 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  30.51 
 
 
135 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  39.33 
 
 
120 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  29.92 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 
265 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  33.03 
 
 
123 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  33.03 
 
 
123 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1015  hypothetical protein  36.96 
 
 
121 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0640  hypothetical protein  33.72 
 
 
113 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4720  hypothetical protein  31.34 
 
 
258 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0607  hypothetical protein  36.96 
 
 
121 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2441  hypothetical protein  36.96 
 
 
121 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0850  hypothetical protein  36.96 
 
 
121 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0855  hypothetical protein  36.96 
 
 
121 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.545031  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  33.03 
 
 
123 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0055  hypothetical protein  36.96 
 
 
121 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11074  hypothetical protein  32.03 
 
 
254 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0277375  normal  0.0429341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  31.86 
 
 
125 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  28.32 
 
 
517 aa  52  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>