165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0310 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  239  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  92.37 
 
 		 118 aa  224  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  78.81 
 
 		 118 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  60.68 
 
 		 121 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  58.12 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  55.56 
 
 		 135 aa  135  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  55.56 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  54.7 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  53.85 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  54.31 
 
 		 135 aa  133  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  55.75 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  53.85 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  53.1 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  52.59 
 
 		 125 aa  126  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  51.33 
 
 		 121 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  50.86 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  48.72 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  49.57 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  50.89 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  59.48 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  49.57 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  45.3 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  49.56 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  52.14 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  52.14 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  45.3 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  52.14 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  50 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  48.21 
 
 		 123 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  48.21 
 
 		 123 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  48.21 
 
 		 123 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  47.41 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  52.63 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  51.35 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  48.65 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  45.54 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  48.28 
 
 		 225 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  48.28 
 
 		 241 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  48.28 
 
 		 241 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  45.13 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  48.67 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  39.32 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  41.03 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  40.17 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0640  hypothetical protein  47.52 
 
 		 113 aa  97.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  45.95 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  40.35 
 
 		 185 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  43.27 
 
 		 113 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  43.52 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  41.44 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  44.04 
 
 		 274 aa  90.5  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  40.54 
 
 		 130 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  45.36 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  44.33 
 
 		 175 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  41.67 
 
 		 165 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  40.62 
 
 		 165 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  45.83 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  46.32 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  40.19 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  41.58 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  36.45 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  36.94 
 
 		 265 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  38.18 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  38.14 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  37.11 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  39.56 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  34.82 
 
 		 517 aa  77  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0677  hypothetical protein  40.91 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782308  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1974  hypothetical protein  39.56 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  36.7 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  33.61 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0682  hypothetical protein  39.56 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  34.26 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  36.79 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  31.96 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  35.78 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11074  hypothetical protein  40.21 
 
 		 254 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0277375  normal  0.0429341 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11076  DUF427 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02220)  37.5 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  39.58 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2004  hypothetical protein  37.38 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2614  hypothetical protein  37.38 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.899878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2643  hypothetical protein  37.38 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  36.63 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  30.61 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  30.61 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0175  protein of unknown function DUF427  35.4 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  38.32 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  36.46 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  35.71 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  34.86 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3377  hypothetical protein  49.23 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0684  hypothetical protein  40.82 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.835024  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  34.31 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  35.51 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  30.51 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2009  hypothetical protein  31.19 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0850  hypothetical protein  40.18 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  35.42 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5196  hypothetical protein  36.94 
 
 		 268 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>