162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4352 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  71.31 
 
 		 135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  66.94 
 
 		 125 aa  179  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  69.29 
 
 		 135 aa  178  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  67.2 
 
 		 127 aa  177  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  69.35 
 
 		 135 aa  177  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  69.35 
 
 		 135 aa  177  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  68.64 
 
 		 213 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  65.29 
 
 		 124 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  70.59 
 
 		 241 aa  174  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  70.59 
 
 		 225 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  70.59 
 
 		 241 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  69.42 
 
 		 132 aa  174  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  68.6 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  63.2 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  61.98 
 
 		 125 aa  167  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  62.6 
 
 		 125 aa  161  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  71.67 
 
 		 135 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  71.67 
 
 		 135 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  71.67 
 
 		 135 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  61.06 
 
 		 120 aa  151  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  61.4 
 
 		 120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  58.41 
 
 		 120 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  61.95 
 
 		 120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  58.41 
 
 		 121 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  60.5 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  54.31 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  59.26 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  59.26 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  52.59 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  57.14 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  57.14 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  57.14 
 
 		 123 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  52.1 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  52.59 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  54.63 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  52.38 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  51.72 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  55.46 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  53.1 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  46.72 
 
 		 185 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  49.14 
 
 		 118 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  55.17 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  48.62 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  47.71 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  49.56 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0473  hypothetical protein  46.43 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374421  normal  0.0376651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0640  hypothetical protein  50.5 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  42.2 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  48.98 
 
 		 165 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  45.92 
 
 		 165 aa  94  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  41.12 
 
 		 165 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  40.71 
 
 		 265 aa  90.9  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  40.2 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  43.93 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  43.3 
 
 		 274 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0677  hypothetical protein  42.86 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.782308  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  41.35 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0684  hypothetical protein  41.07 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.835024  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1974  hypothetical protein  38.1 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0682  hypothetical protein  38.1 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  41.41 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  40.19 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  32.8 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  41.3 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  39.39 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2004  hypothetical protein  39.39 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2614  hypothetical protein  39.39 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.899878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2643  hypothetical protein  39.39 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  39.25 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  41.84 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2534  hypothetical protein  41.41 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975897  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  38.78 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2009  hypothetical protein  37.61 
 
 		 248 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1015  hypothetical protein  41.23 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0607  hypothetical protein  41.23 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2441  hypothetical protein  41.23 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0850  hypothetical protein  41.23 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0855  hypothetical protein  41.23 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.545031  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0055  hypothetical protein  41.23 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11074  hypothetical protein  40.2 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0277375  normal  0.0429341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  34.26 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  30.63 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0175  protein of unknown function DUF427  36.28 
 
 		 297 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  34.69 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0198  hypothetical protein  38.38 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.057512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  30 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  35.35 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  33.03 
 
 		 249 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4720  hypothetical protein  35.29 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  32.32 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2033  hypothetical protein  34.17 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2079  hypothetical protein  34.17 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.601553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  32 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11076  DUF427 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02220)  36.36 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  33.6 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>