63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1034 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1034  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  327  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0173454  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1757  hypothetical protein  63.46 
 
 
160 aa  220  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.860278  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  48.72 
 
 
156 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  45.03 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2745  hypothetical protein  45.03 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390999  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  43.05 
 
 
166 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  43.05 
 
 
166 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  47.02 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  41.72 
 
 
166 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  45.33 
 
 
175 aa  128  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  44.37 
 
 
164 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  45.7 
 
 
165 aa  123  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  41.72 
 
 
163 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  45.03 
 
 
165 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  41.06 
 
 
175 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  43.05 
 
 
165 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  42.95 
 
 
165 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  43.71 
 
 
166 aa  120  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  41.72 
 
 
166 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  41.06 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  42.28 
 
 
165 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  38 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  37.84 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4011  protein of unknown function DUF427  39.49 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2920  protein of unknown function DUF427  39.61 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000166616  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  40.4 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  40.54 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  37.75 
 
 
164 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  37.75 
 
 
164 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  36.42 
 
 
164 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  38 
 
 
166 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  38.41 
 
 
164 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  38.41 
 
 
164 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0497  protein of unknown function DUF427  36.84 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3412  hypothetical protein  33.77 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  31 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  27.78 
 
 
132 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  34.48 
 
 
120 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  29.06 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2252  hypothetical protein  28.28 
 
 
225 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  28.32 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  27.72 
 
 
118 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  27.35 
 
 
121 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11076  DUF427 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02220)  34.25 
 
 
100 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4092  hypothetical protein  40 
 
 
254 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681938  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  26.73 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  26.26 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  26.13 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  28.68 
 
 
270 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  28.46 
 
 
274 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  25.45 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2033  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  26.56 
 
 
265 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2079  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.601553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  28.89 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  24.35 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  26.36 
 
 
120 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2016  hypothetical protein  23.96 
 
 
231 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.892245  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0782  hypothetical protein  28.09 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.060697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  27.78 
 
 
120 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  26.73 
 
 
113 aa  40.8  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  21.82 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  24.03 
 
 
249 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>