152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1659 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1659  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  192  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1745  hypothetical protein  63.74 
 
 
94 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0354248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0506  protein of unknown function DUF427  63.33 
 
 
94 aa  135  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107078  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5114  protein of unknown function DUF427  61.54 
 
 
98 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2662  hypothetical protein  64.44 
 
 
95 aa  132  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194389  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0252  hypothetical protein  62.64 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3292  protein of unknown function DUF427  60.22 
 
 
93 aa  131  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237584  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2564  hypothetical protein  63.33 
 
 
94 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.440032  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1854  hypothetical protein  62.22 
 
 
94 aa  131  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189949  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3986  protein of unknown function DUF427  63.33 
 
 
94 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0029  hypothetical protein  62.37 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.54022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0315  protein of unknown function DUF427  59.14 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1271  hypothetical protein  60.44 
 
 
93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1404  protein of unknown function DUF427  62.22 
 
 
94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.944619 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13333  hypothetical protein  60.22 
 
 
93 aa  124  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.430926  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0782  hypothetical protein  59.34 
 
 
92 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.060697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4960  protein of unknown function DUF427  58.06 
 
 
93 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0367366  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5420  protein of unknown function DUF427  60 
 
 
94 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0261431  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0006  protein of unknown function DUF427  59.55 
 
 
94 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0004  protein of unknown function DUF427  59.55 
 
 
94 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0837  hypothetical protein  55.91 
 
 
93 aa  118  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.394085  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1381  hypothetical protein  58.7 
 
 
92 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1644  hypothetical protein  53.85 
 
 
106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.891055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3460  hypothetical protein  58.24 
 
 
93 aa  115  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.967633  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6918  protein of unknown function DUF427  58.89 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.626573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  50.54 
 
 
102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3182  protein of unknown function DUF427  51.65 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2235  hypothetical protein  54.95 
 
 
93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124766  hitchhiker  0.000411193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3657  protein of unknown function DUF427  55.43 
 
 
94 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2270  hypothetical protein  52.81 
 
 
94 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2442  hypothetical protein  54.95 
 
 
94 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.88433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16580  hypothetical protein  52.17 
 
 
95 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.286452 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0111  hypothetical protein  48.35 
 
 
93 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0965  hypothetical protein  45.65 
 
 
94 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139662 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11687  hypothetical protein  47.87 
 
 
115 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209291  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3377  hypothetical protein  51.35 
 
 
75 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1748  hypothetical protein  46.74 
 
 
94 aa  90.5  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.803353  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0438  hypothetical protein  47.73 
 
 
94 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06900  conserved hypothetical protein  45.57 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470322  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11076  DUF427 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02220)  41.46 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  34.88 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1974  hypothetical protein  41.03 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0682  hypothetical protein  41.03 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  31.18 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  35.94 
 
 
274 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  44.3 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  37.23 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  34.52 
 
 
164 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  40.58 
 
 
270 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  31.33 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  31.87 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  26.09 
 
 
165 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  29.67 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  36 
 
 
164 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  29.67 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  29.67 
 
 
164 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  29.67 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  32.14 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  35.94 
 
 
120 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  37.35 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  30.77 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  30.93 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2004  hypothetical protein  39.68 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.515923  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  30.93 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  30.12 
 
 
125 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2614  hypothetical protein  39.68 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.899878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2643  hypothetical protein  39.68 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  37.31 
 
 
265 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  39.68 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  30.11 
 
 
169 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  26.88 
 
 
175 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  38.46 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  32.84 
 
 
126 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  28.57 
 
 
166 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  31.71 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  27.38 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  31.87 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  27.38 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  31.03 
 
 
123 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  27.47 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  32.81 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  31.94 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2534  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975897  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  30.95 
 
 
164 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  25 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  29.89 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  29.89 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  38.1 
 
 
166 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0684  hypothetical protein  36.51 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.835024  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  36.51 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  30.16 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  27.96 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3412  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  29.55 
 
 
175 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  26.37 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0640  hypothetical protein  31.94 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>