122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11687 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11687  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  235  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209291  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5114  protein of unknown function DUF427  61.05 
 
 
98 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2564  hypothetical protein  57.73 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.440032  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1854  hypothetical protein  57.73 
 
 
94 aa  117  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189949  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0506  protein of unknown function DUF427  54.64 
 
 
94 aa  114  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107078  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16580  hypothetical protein  55.79 
 
 
95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.286452 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0315  protein of unknown function DUF427  53.19 
 
 
93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0782  hypothetical protein  50.53 
 
 
92 aa  111  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.060697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2662  hypothetical protein  54.17 
 
 
95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194389  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3986  protein of unknown function DUF427  53.12 
 
 
94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1404  protein of unknown function DUF427  52.58 
 
 
94 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.944619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1644  hypothetical protein  59.57 
 
 
106 aa  110  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.891055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  57.45 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3182  protein of unknown function DUF427  52.63 
 
 
93 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2270  hypothetical protein  54.74 
 
 
94 aa  107  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0252  hypothetical protein  48.42 
 
 
93 aa  107  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1271  hypothetical protein  50.53 
 
 
93 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1381  hypothetical protein  52.13 
 
 
92 aa  103  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0837  hypothetical protein  51.06 
 
 
93 aa  103  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.394085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1745  hypothetical protein  54.26 
 
 
94 aa  103  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0354248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3292  protein of unknown function DUF427  54.26 
 
 
93 aa  103  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237584  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2442  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  103  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.88433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3657  protein of unknown function DUF427  50 
 
 
94 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5420  protein of unknown function DUF427  53.61 
 
 
94 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0261431  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13333  hypothetical protein  47.87 
 
 
93 aa  101  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.430926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0029  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.54022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2235  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124766  hitchhiker  0.000411193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6918  protein of unknown function DUF427  54.74 
 
 
94 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.626573  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0111  hypothetical protein  48.42 
 
 
93 aa  98.2  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0004  protein of unknown function DUF427  46.88 
 
 
94 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0006  protein of unknown function DUF427  46.88 
 
 
94 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1659  hypothetical protein  47.87 
 
 
93 aa  97.1  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3460  hypothetical protein  47.37 
 
 
93 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.967633  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4960  protein of unknown function DUF427  47.87 
 
 
93 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0367366  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3377  hypothetical protein  52.63 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0965  hypothetical protein  41.05 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139662 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1748  hypothetical protein  41.67 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.803353  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0438  hypothetical protein  45.16 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11076  DUF427 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02220)  41.98 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  37.23 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  37.23 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  39.18 
 
 
166 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  37.23 
 
 
164 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  37.23 
 
 
164 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06900  conserved hypothetical protein  42.39 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  45.45 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  36.08 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3412  hypothetical protein  36.56 
 
 
164 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  35.11 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  35.11 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  36.46 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  38.95 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  36.27 
 
 
113 aa  53.9  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  34.04 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  34.04 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  34.83 
 
 
124 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  32.98 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  32.98 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  32.98 
 
 
123 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  31.46 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0684  hypothetical protein  36.17 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.835024  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  34.04 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  30.69 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0175  protein of unknown function DUF427  31.78 
 
 
297 aa  50.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
517 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  30.28 
 
 
274 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  30.85 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  32.98 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  30.85 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0640  hypothetical protein  31.96 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  34.02 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  31.25 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  32.94 
 
 
122 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  33.33 
 
 
249 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  34.38 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  32.98 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0198  hypothetical protein  33.68 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.057512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  37.31 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0840  hypothetical protein  30.85 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  31.91 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  29.7 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2033  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2079  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.601553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4720  hypothetical protein  37.35 
 
 
258 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1974  hypothetical protein  31.96 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0682  hypothetical protein  31.96 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  33.77 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  33.77 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  32.84 
 
 
132 aa  43.9  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  35.71 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5108  hypothetical protein  33.65 
 
 
268 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5196  hypothetical protein  33.65 
 
 
268 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5487  hypothetical protein  33.65 
 
 
268 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304814  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2661  hypothetical protein  31.91 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  31.91 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  34.38 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  32.98 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  28.71 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  32.84 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>