120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0259 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0259  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  807    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.881975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0565  protein of unknown function DUF610, YibQ  86.55 
 
 		 411 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0165  protein of unknown function DUF610 YibQ  75.85 
 
 		 412 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0167  protein of unknown function DUF610, YibQ  66.67 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0526  protein of unknown function DUF610, YibQ  67.82 
 
 		 401 aa  525  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0450  hypothetical protein  62.65 
 
 		 400 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.182415  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0413  hypothetical protein  63.88 
 
 		 407 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4734  protein of unknown function DUF610 YibQ  41.71 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00807968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4224  protein of unknown function DUF610 YibQ  42.34 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2243  protein of unknown function DUF610 YibQ  41.5 
 
 		 399 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.192281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2286  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.39 
 
 		 418 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  0.0682308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2561  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.11 
 
 		 401 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0378408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1471  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.94 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0097  protein of unknown function DUF610 YibQ  46.69 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4210  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.69 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3450  protein of unknown function DUF610, YibQ  40.55 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3886  protein of unknown function DUF610 YibQ  34 
 
 		 397 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0615544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2797  protein of unknown function DUF610, YibQ  40.61 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4301  hypothetical protein  39.71 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1063  protein of unknown function DUF610 YibQ  42.52 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.450222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3017  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.52 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4726  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.84 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0150774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1231  hypothetical protein  35.74 
 
 		 582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253102  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.96 
 
 		 482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  32.29 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2160  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.72 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.820205  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  30 
 
 		 315 aa  93.6  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3959  hypothetical protein  29.47 
 
 		 256 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1248  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.36 
 
 		 256 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1385  hypothetical protein  29.47 
 
 		 256 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1447  hypothetical protein  28.42 
 
 		 256 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1250  hypothetical protein  28.42 
 
 		 256 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1225  divergent polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 256 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1349  hypothetical protein  28.42 
 
 		 256 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1422  hypothetical protein  28.42 
 
 		 256 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010501 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1488  hypothetical protein  28.42 
 
 		 256 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1223  divergent polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 259 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00241511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  26.98 
 
 		 290 aa  87.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2867  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.29 
 
 		 433 aa  87  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00589273  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1402  protein of unknown function DUF610, YibQ  30.23 
 
 		 350 aa  86.3  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.336614  hitchhiker  0.000448434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.07 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000290484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.15 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1888  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.23 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.811898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1577  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.11 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0623724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  27.66 
 
 		 488 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1057  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.87 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4393  hypothetical protein  28.37 
 
 		 259 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.05 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1161  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.32 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1672  hypothetical protein  26.46 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0953681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.42 
 
 		 543 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.61 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0902  protein of unknown function DUF610, YibQ  32.42 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3030  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.47 
 
 		 316 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0726  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.43 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.47 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.74 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5870  hypothetical protein  27.03 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3701  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.47 
 
 		 245 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67820  hypothetical protein  26.73 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0057  protein of unknown function DUF610, YibQ  23.94 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0042  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.23 
 
 		 251 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185934  hitchhiker  0.000313161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0040  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.23 
 
 		 251 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288732 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3809  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.47 
 
 		 251 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69946  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  24.88 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0048  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.23 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.32 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5110  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.57 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4888  hypothetical protein  24.2 
 
 		 260 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3609  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.34 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0037  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.12 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0406  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.57 
 
 		 259 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5330  hypothetical protein  24.65 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3169  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.35 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0895  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.75 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0461131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4880  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.11 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4023  protein of unknown function DUF610, YibQ  23 
 
 		 238 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.958404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3289  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.69 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2408  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.41 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000297515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5059  hypothetical protein  27.23 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4932  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.23 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1209  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.29 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1442  hypothetical protein  23.5 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0046  hypothetical protein  22.48 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4043  polysaccharide deacetylase family protein  21.65 
 
 		 319 aa  53.9  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451562  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4366  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.07 
 
 		 313 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0121  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.07 
 
 		 314 aa  53.1  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0040  protein of unknown function DUF610 YibQ  21.5 
 
 		 251 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  22.68 
 
 		 320 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  22.68 
 
 		 320 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4220  protein of unknown function DUF610 YibQ  21.23 
 
 		 251 aa  53.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  22.68 
 
 		 320 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  22.68 
 
 		 320 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0491  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.12 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2503  hypothetical protein  25.88 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2567  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.09 
 
 		 264 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245403  hitchhiker  0.00802538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4335  hypothetical protein  21.96 
 
 		 251 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.936409  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  22.68 
 
 		 320 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0793  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.96 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  21.5 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000152753 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>