52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0902 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0902  protein of unknown function DUF610, YibQ  100 
 
 		 327 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1471  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.19 
 
 		 426 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2243  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.16 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.192281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0450  hypothetical protein  33.46 
 
 		 400 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.182415  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4726  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.15 
 
 		 395 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0150774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0526  protein of unknown function DUF610, YibQ  32.25 
 
 		 401 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3017  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.84 
 
 		 399 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1231  hypothetical protein  35.97 
 
 		 582 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0167  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.01 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2561  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.68 
 
 		 401 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0378408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2286  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.23 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  0.0682308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3450  protein of unknown function DUF610, YibQ  28.52 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177141  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1063  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.25 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.450222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2797  protein of unknown function DUF610, YibQ  30.2 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4301  hypothetical protein  28.82 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0565  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.79 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0413  hypothetical protein  31.39 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4224  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.32 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0165  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.37 
 
 		 412 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0259  hypothetical protein  32.42 
 
 		 405 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.881975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3886  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.24 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0615544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4210  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.94 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4734  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.1 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00807968  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  29.03 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  29.07 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0097  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.04 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4393  hypothetical protein  22.97 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67820  hypothetical protein  27.31 
 
 		 257 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.94 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4220  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.98 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.03 
 
 		 430 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0040  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.34 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0042  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.46 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185934  hitchhiker  0.000313161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.89 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5870  hypothetical protein  26.55 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0048  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.34 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0046  hypothetical protein  24.55 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0726  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.48 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0057  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.11 
 
 		 250 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0406  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.48 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3809  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.78 
 
 		 251 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69946  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.27 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000152753 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0037  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.97 
 
 		 247 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0040  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.94 
 
 		 251 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2567  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.32 
 
 		 264 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245403  hitchhiker  0.00802538 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.38 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.244614  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0121  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.32 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>