115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0526 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0450  hypothetical protein  79.5 
 
 		 400 aa  636    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.182415  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0526  protein of unknown function DUF610, YibQ  100 
 
 		 401 aa  796    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0167  protein of unknown function DUF610, YibQ  66.34 
 
 		 412 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0259  hypothetical protein  67.82 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.881975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0413  hypothetical protein  68.7 
 
 		 407 aa  505  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0565  protein of unknown function DUF610, YibQ  66.67 
 
 		 411 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0165  protein of unknown function DUF610 YibQ  63.33 
 
 		 412 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4734  protein of unknown function DUF610 YibQ  43.11 
 
 		 404 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00807968  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2243  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.65 
 
 		 399 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.192281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4224  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.55 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2286  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.79 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  0.0682308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2561  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.51 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0378408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1471  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.44 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3450  protein of unknown function DUF610, YibQ  42.8 
 
 		 330 aa  206  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3886  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.4 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0615544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0097  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.12 
 
 		 411 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4210  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.61 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4301  hypothetical protein  41.57 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1063  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.1 
 
 		 407 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.450222  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3017  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.15 
 
 		 399 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2797  protein of unknown function DUF610, YibQ  40.23 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4726  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.41 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0150774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1231  hypothetical protein  38.17 
 
 		 582 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253102  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  32.88 
 
 		 482 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  30.64 
 
 		 432 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2160  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.71 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.820205  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0902  protein of unknown function DUF610, YibQ  32.25 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.47 
 
 		 315 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.06 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1402  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.52 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.336614  hitchhiker  0.000448434 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1577  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.32 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0623724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1250  hypothetical protein  27.64 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1223  divergent polysaccharide deacetylase  27.64 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00241511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1225  divergent polysaccharide deacetylase  27.64 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1349  hypothetical protein  27.64 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1422  hypothetical protein  27.64 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010501 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1447  hypothetical protein  29.55 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1488  hypothetical protein  29.55 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  25.11 
 
 		 290 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2867  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.24 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00589273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1672  hypothetical protein  27.94 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0953681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.42 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1248  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.13 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0726  protein of unknown function DUF610 YibQ  28 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  23.72 
 
 		 320 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000290484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1385  hypothetical protein  25.79 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3959  hypothetical protein  25.79 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.23 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1888  protein of unknown function DUF610, YibQ  23.7 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.811898  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4393  hypothetical protein  25.91 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355053  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.89 
 
 		 543 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  24.17 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1161  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.25 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1057  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.36 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.88 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  25 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3030  protein of unknown function DUF610 YibQ  24.19 
 
 		 316 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3169  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.71 
 
 		 272 aa  67  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  25.58 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0057  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.03 
 
 		 250 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67820  hypothetical protein  25.33 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  24.62 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3701  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.53 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5870  hypothetical protein  24.77 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3289  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.32 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1209  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.36 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4880  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.94 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0042  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.79 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185934  hitchhiker  0.000313161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0040  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.79 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0048  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.79 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0895  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.36 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0461131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4366  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.47 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4043  polysaccharide deacetylase family protein  22.68 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451562  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  21.4 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5330  hypothetical protein  22.67 
 
 		 260 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0091  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.68 
 
 		 319 aa  57  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4888  hypothetical protein  22.79 
 
 		 260 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1442  hypothetical protein  25.41 
 
 		 270 aa  57  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4085  hypothetical protein  23 
 
 		 315 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03472  predicted polysaccharide deacetylase  22.68 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03423  hypothetical protein  22.68 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.511041  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0037  protein of unknown function DUF610, YibQ  23.64 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3826  polysaccharide deacetylase family protein  22.68 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.686921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4119  polysaccharide deacetylase family protein  22.68 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4821  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.6 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  hitchhiker  0.000223669 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0094  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.68 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3952  polysaccharide deacetylase family protein  22.68 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4987  polysaccharide deacetylase family protein  22.68 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0046  hypothetical protein  22.32 
 
 		 251 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5110  protein of unknown function DUF610 YibQ  24.78 
 
 		 259 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3943  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.59 
 
 		 309 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3609  protein of unknown function DUF610, YibQ  21.96 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3809  protein of unknown function DUF610, YibQ  23.58 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69946  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0121  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.56 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0073  divergent polysaccharide deacetylase  23.11 
 
 		 336 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4143  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.11 
 
 		 336 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>