120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1063 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1063  protein of unknown function DUF610 YibQ  100 
 
 		 407 aa  822    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.450222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3450  protein of unknown function DUF610, YibQ  61.79 
 
 		 330 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3017  protein of unknown function DUF610 YibQ  46.49 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3886  protein of unknown function DUF610 YibQ  43.86 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0615544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4210  protein of unknown function DUF610 YibQ  54.71 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4301  hypothetical protein  40.93 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1471  protein of unknown function DUF610 YibQ  46.44 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2797  protein of unknown function DUF610, YibQ  44.44 
 
 		 445 aa  212  7.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0450  hypothetical protein  43.97 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.182415  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2243  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.85 
 
 		 399 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.192281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0526  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.1 
 
 		 401 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4734  protein of unknown function DUF610 YibQ  44.57 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00807968  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2286  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.13 
 
 		 418 aa  199  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  0.0682308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2561  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.77 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0378408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4224  protein of unknown function DUF610 YibQ  45.15 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0565  protein of unknown function DUF610, YibQ  42.91 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0413  hypothetical protein  43.25 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0167  protein of unknown function DUF610, YibQ  34.79 
 
 		 412 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0259  hypothetical protein  42.52 
 
 		 405 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.881975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0165  protein of unknown function DUF610 YibQ  41.34 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4726  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.02 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0150774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0097  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.84 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1231  hypothetical protein  35.36 
 
 		 582 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253102  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  34.86 
 
 		 482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  34.56 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2160  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.36 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.820205  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  29.07 
 
 		 430 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.33 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302345  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  31.28 
 
 		 488 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  30.45 
 
 		 461 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2867  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.03 
 
 		 433 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00589273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1672  hypothetical protein  29.73 
 
 		 395 aa  96.3  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0953681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.22 
 
 		 543 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  30.57 
 
 		 290 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1577  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.6 
 
 		 271 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0623724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.27 
 
 		 253 aa  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1888  protein of unknown function DUF610, YibQ  28.77 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.811898  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1402  protein of unknown function DUF610, YibQ  28.3 
 
 		 350 aa  88.2  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.336614  hitchhiker  0.000448434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0902  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.88 
 
 		 327 aa  88.2  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3289  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.13 
 
 		 279 aa  87  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.06 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000290484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.82 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3030  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.51 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2567  protein of unknown function DUF610, YibQ  28.77 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245403  hitchhiker  0.00802538 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3169  protein of unknown function DUF610, YibQ  28.63 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.94 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3701  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.73 
 
 		 245 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4393  hypothetical protein  26.01 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0042  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.76 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185934  hitchhiker  0.000313161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0040  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.76 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0048  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.76 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1161  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.39 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.9 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67820  hypothetical protein  29.03 
 
 		 257 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2408  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.97 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000297515  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0046  hypothetical protein  26.13 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5110  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.52 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5059  hypothetical protein  27.35 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4932  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.35 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.22 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000152753 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0091  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.87 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4888  hypothetical protein  26.03 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03472  predicted polysaccharide deacetylase  23.87 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5330  hypothetical protein  26.26 
 
 		 260 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0057  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.44 
 
 		 250 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0726  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.61 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1057  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.91 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3826  polysaccharide deacetylase family protein  23.87 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.686921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4119  polysaccharide deacetylase family protein  23.87 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03423  hypothetical protein  23.87 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.511041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0094  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.87 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3952  polysaccharide deacetylase family protein  23.87 
 
 		 319 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4043  polysaccharide deacetylase family protein  23.87 
 
 		 319 aa  76.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4987  polysaccharide deacetylase family protein  23.87 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1209  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.73 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5870  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0073  divergent polysaccharide deacetylase  24.67 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4143  protein of unknown function DUF610 YibQ  24.67 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  23.02 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4335  hypothetical protein  23.89 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.936409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0406  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.15 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00545  hypothetical protein  26.01 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.671314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3609  protein of unknown function DUF610, YibQ  23.66 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0040  protein of unknown function DUF610 YibQ  24.34 
 
 		 251 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4880  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.11 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0895  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.05 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0461131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0121  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.32 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3959  hypothetical protein  26.74 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4085  hypothetical protein  22.77 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  24.34 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.244614  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1385  hypothetical protein  27.06 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0037  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.77 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4023  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.55 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.958404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1225  divergent polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1422  hypothetical protein  27.54 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010501 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>