122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4210 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4210  protein of unknown function DUF610 YibQ  100 
 
 		 398 aa  801    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3886  protein of unknown function DUF610 YibQ  94.72 
 
 		 397 aa  760    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0615544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3017  protein of unknown function DUF610 YibQ  58.19 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4301  hypothetical protein  59.39 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1063  protein of unknown function DUF610 YibQ  44.71 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.450222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3450  protein of unknown function DUF610, YibQ  52.69 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177141  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2243  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.25 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.192281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0526  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.91 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1471  protein of unknown function DUF610 YibQ  41.89 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4734  protein of unknown function DUF610 YibQ  43.46 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00807968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0167  protein of unknown function DUF610, YibQ  36 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2286  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.45 
 
 		 418 aa  199  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  0.0682308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2561  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.13 
 
 		 401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0378408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4224  protein of unknown function DUF610 YibQ  43.3 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0450  hypothetical protein  35.44 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.182415  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2797  protein of unknown function DUF610, YibQ  42.52 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0259  hypothetical protein  39.69 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.881975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0565  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.93 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0165  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.06 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0413  hypothetical protein  34.64 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0097  protein of unknown function DUF610 YibQ  42.58 
 
 		 411 aa  170  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4726  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.4 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0150774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1231  hypothetical protein  36.59 
 
 		 582 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253102  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2160  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.31 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.820205  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  30.67 
 
 		 482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.57 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.96 
 
 		 543 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.73 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  28.7 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1402  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.4 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.336614  hitchhiker  0.000448434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  27.54 
 
 		 488 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1672  hypothetical protein  26.59 
 
 		 395 aa  86.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0953681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.85 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000290484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.82 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.79 
 
 		 461 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2867  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.7 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00589273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5330  hypothetical protein  23.39 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4888  hypothetical protein  23.75 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.57 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.34 
 
 		 253 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00545  hypothetical protein  26.01 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.671314  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  27 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3609  protein of unknown function DUF610, YibQ  23.11 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0902  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.94 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3030  protein of unknown function DUF610 YibQ  24.66 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1126  putative periplasmic protein  26.71 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3701  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.34 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4393  hypothetical protein  26.67 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2567  protein of unknown function DUF610, YibQ  23.83 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245403  hitchhiker  0.00802538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  25 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1577  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.86 
 
 		 271 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0623724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1888  protein of unknown function DUF610, YibQ  23.85 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.811898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1057  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.16 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5110  protein of unknown function DUF610 YibQ  24.88 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1248  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.14 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67820  hypothetical protein  26.07 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3809  protein of unknown function DUF610, YibQ  23.39 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69946  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3289  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.93 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1385  hypothetical protein  26.63 
 
 		 256 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1447  hypothetical protein  26.34 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1422  hypothetical protein  26.34 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010501 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1250  hypothetical protein  26.34 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1225  divergent polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0330  hypothetical protein  24.11 
 
 		 258 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1349  hypothetical protein  26.34 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1442  hypothetical protein  23.04 
 
 		 270 aa  62.8  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5870  hypothetical protein  25.59 
 
 		 258 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3959  hypothetical protein  26.34 
 
 		 256 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0406  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.18 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1488  hypothetical protein  26.34 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03472  predicted polysaccharide deacetylase  21.52 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0091  protein of unknown function DUF610 YibQ  21.52 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1223  divergent polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 259 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00241511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03423  hypothetical protein  21.52 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.511041  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3826  polysaccharide deacetylase family protein  21.52 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.686921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4119  polysaccharide deacetylase family protein  21.52 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0094  protein of unknown function DUF610 YibQ  21.52 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3952  polysaccharide deacetylase family protein  21.52 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4987  polysaccharide deacetylase family protein  21.52 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0121  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.5 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1366  putative periplasmic protein  26.06 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.668275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2004  ferric-uptake regulator  29.93 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1209  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.73 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4043  polysaccharide deacetylase family protein  22.46 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451562  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0870  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.11 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3169  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.93 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1161  protein of unknown function DUF610 YibQ  24.02 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4880  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.77 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0073  divergent polysaccharide deacetylase  22.27 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4143  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.27 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1659  hypothetical protein  30.68 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5059  hypothetical protein  24.53 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4023  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.73 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.958404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4932  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.53 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>