112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0167 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0167  protein of unknown function DUF610, YibQ  100 
 
 		 412 aa  826    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0526  protein of unknown function DUF610, YibQ  66.34 
 
 		 401 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89558  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0259  hypothetical protein  66.1 
 
 		 405 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.881975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0165  protein of unknown function DUF610 YibQ  63.02 
 
 		 412 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0565  protein of unknown function DUF610, YibQ  65.61 
 
 		 411 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0450  hypothetical protein  63.66 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.182415  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0413  hypothetical protein  64.72 
 
 		 407 aa  474  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4734  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.34 
 
 		 404 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00807968  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2243  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.98 
 
 		 399 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.192281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4224  protein of unknown function DUF610 YibQ  49.81 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2286  protein of unknown function DUF610 YibQ  45.11 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  0.0682308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2561  protein of unknown function DUF610 YibQ  45.11 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0378408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1471  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.84 
 
 		 426 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0097  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.67 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4210  protein of unknown function DUF610 YibQ  36 
 
 		 398 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3886  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.8 
 
 		 397 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0615544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3017  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.47 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3450  protein of unknown function DUF610, YibQ  38.66 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2797  protein of unknown function DUF610, YibQ  40.3 
 
 		 445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1063  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.79 
 
 		 407 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.450222  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4301  hypothetical protein  37.27 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4726  protein of unknown function DUF610 YibQ  41.11 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0150774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1231  hypothetical protein  34.58 
 
 		 582 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253102  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  29.13 
 
 		 482 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  29.8 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2160  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.61 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.820205  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0902  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.01 
 
 		 327 aa  86.7  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  25.69 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.91 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1577  protein of unknown function DUF610, YibQ  25 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0623724  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1672  hypothetical protein  27.31 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0953681  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1402  protein of unknown function DUF610, YibQ  29.95 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.336614  hitchhiker  0.000448434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2867  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.33 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00589273  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.25 
 
 		 543 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1888  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.53 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.811898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1447  hypothetical protein  28.49 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.73 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1250  hypothetical protein  28.49 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1223  divergent polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 259 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00241511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1225  divergent polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1349  hypothetical protein  28.49 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0726  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.43 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1488  hypothetical protein  28.49 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1422  hypothetical protein  28.49 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1248  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.87 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  24.19 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  25.98 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1385  hypothetical protein  28.49 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3959  hypothetical protein  28.49 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.22 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000290484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5870  hypothetical protein  27.78 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4393  hypothetical protein  27.8 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3030  protein of unknown function DUF610 YibQ  21.69 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.22 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67820  hypothetical protein  27.78 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.21 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.45 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5330  hypothetical protein  26.42 
 
 		 260 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1161  protein of unknown function DUF610 YibQ  21.31 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1057  protein of unknown function DUF610 YibQ  24.12 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4821  protein of unknown function DUF610 YibQ  24.03 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  hitchhiker  0.000223669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4888  hypothetical protein  25.55 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  24.49 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5110  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.63 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0042  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.94 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185934  hitchhiker  0.000313161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0040  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.94 
 
 		 251 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288732 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3809  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.98 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69946  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0048  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.94 
 
 		 251 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2408  protein of unknown function DUF610, YibQ  23.11 
 
 		 342 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000297515  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1209  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.18 
 
 		 272 aa  53.9  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  23.71 
 
 		 320 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  23.71 
 
 		 320 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  23.71 
 
 		 320 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  23.71 
 
 		 320 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  23.71 
 
 		 320 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3289  protein of unknown function DUF610 YibQ  24.78 
 
 		 279 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3169  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.17 
 
 		 272 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  23.14 
 
 		 253 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0406  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.22 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4043  polysaccharide deacetylase family protein  23.2 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451562  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0091  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.2 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0491  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.47 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03472  predicted polysaccharide deacetylase  23.2 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5059  hypothetical protein  26.32 
 
 		 255 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3701  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.77 
 
 		 245 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03423  hypothetical protein  23.2 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.511041  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3943  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.08 
 
 		 309 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4932  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.32 
 
 		 255 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3826  polysaccharide deacetylase family protein  23.2 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.686921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4119  polysaccharide deacetylase family protein  23.2 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0094  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.2 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3952  polysaccharide deacetylase family protein  23.2 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4987  polysaccharide deacetylase family protein  23.2 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4880  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.12 
 
 		 251 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4366  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.54 
 
 		 313 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4085  hypothetical protein  23.15 
 
 		 315 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0895  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.97 
 
 		 490 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0461131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4335  hypothetical protein  22.17 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.936409  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0176  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.08 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.686175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0073  divergent polysaccharide deacetylase  23.15 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>