84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1231 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1231  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1103    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253102  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1471  protein of unknown function DUF610 YibQ  42.69 
 
 		 426 aa  190  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4726  protein of unknown function DUF610 YibQ  41.74 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0150774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4734  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.5 
 
 		 404 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00807968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3450  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.14 
 
 		 330 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2797  protein of unknown function DUF610, YibQ  41.22 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4301  hypothetical protein  34.14 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2243  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.91 
 
 		 399 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.192281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0526  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.55 
 
 		 401 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0167  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.91 
 
 		 412 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0450  hypothetical protein  36.36 
 
 		 400 aa  150  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.182415  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4210  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.59 
 
 		 398 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3886  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.37 
 
 		 397 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0615544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4224  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.46 
 
 		 396 aa  146  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3017  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.66 
 
 		 399 aa  146  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2286  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.02 
 
 		 418 aa  145  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  0.0682308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2561  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.78 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0378408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0565  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.53 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0165  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.4 
 
 		 412 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0413  hypothetical protein  36.33 
 
 		 407 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1063  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.36 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.450222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0259  hypothetical protein  35.74 
 
 		 405 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.881975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0097  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.12 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  30.71 
 
 		 432 aa  104  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  29.68 
 
 		 482 aa  90.5  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0902  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.61 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.44 
 
 		 430 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1402  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.4 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.336614  hitchhiker  0.000448434 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.43 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.77 
 
 		 317 aa  72  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3030  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.77 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.84 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.15 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  28.85 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.35 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000290484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1672  hypothetical protein  26.42 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0953681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1888  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.39 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.811898  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0057  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.2 
 
 		 250 aa  62  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  28.92 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2408  protein of unknown function DUF610, YibQ  28.51 
 
 		 342 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000297515  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0726  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.57 
 
 		 392 aa  60.1  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2160  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.55 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.820205  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0048  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.89 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  25 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0040  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.44 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3959  hypothetical protein  26.76 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0037  protein of unknown function DUF610, YibQ  23.81 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0042  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.44 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185934  hitchhiker  0.000313161 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.34 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1385  hypothetical protein  26.76 
 
 		 256 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67820  hypothetical protein  27.12 
 
 		 257 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1248  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.37 
 
 		 256 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1250  hypothetical protein  26.76 
 
 		 256 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1225  divergent polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 		 256 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1488  hypothetical protein  26.76 
 
 		 256 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1422  hypothetical protein  26.76 
 
 		 256 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010501 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1349  hypothetical protein  26.76 
 
 		 256 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1223  divergent polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 		 259 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00241511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0046  hypothetical protein  24 
 
 		 251 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1447  hypothetical protein  26.76 
 
 		 256 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262297  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5870  hypothetical protein  26.69 
 
 		 258 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4023  protein of unknown function DUF610, YibQ  22.71 
 
 		 238 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.958404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1057  protein of unknown function DUF610 YibQ  24.88 
 
 		 256 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2567  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.46 
 
 		 264 aa  51.6  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245403  hitchhiker  0.00802538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.11 
 
 		 251 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.244614  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3809  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.66 
 
 		 251 aa  51.2  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69946  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4220  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.51 
 
 		 251 aa  51.2  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  27.52 
 
 		 382 aa  50.8  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  24.73 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  24.73 
 
 		 320 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4335  hypothetical protein  22.67 
 
 		 251 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.936409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.67 
 
 		 251 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000152753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  24.73 
 
 		 320 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2867  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.35 
 
 		 433 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00589273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4888  hypothetical protein  26.36 
 
 		 260 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  24.73 
 
 		 320 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  24.73 
 
 		 320 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0040  protein of unknown function DUF610 YibQ  22.67 
 
 		 251 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0121  protein of unknown function DUF610, YibQ  24.73 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1881  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.97 
 
 		 575 aa  46.6  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.176772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3289  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.76 
 
 		 279 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4880  protein of unknown function DUF610 YibQ  23.73 
 
 		 251 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1209  protein of unknown function DUF610, YibQ  29.13 
 
 		 272 aa  45.8  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5330  hypothetical protein  25.93 
 
 		 260 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>