32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4985 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  321  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  69.03 
 
 		 155 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  69.03 
 
 		 173 aa  234  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  64.79 
 
 		 155 aa  207  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6086  hypothetical protein  38.41 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0311  hypothetical protein  37.14 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.6815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0323  hypothetical protein  37.14 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.043806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0320  hypothetical protein  37.14 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.726183  normal  0.0158521 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0402  hypothetical protein  32.37 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0329  hypothetical protein  32.37 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0647  hypothetical protein  35.81 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000601182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0346  hypothetical protein  35.34 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6211  hypothetical protein  33.11 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3691  hypothetical protein  30.37 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0168  hypothetical protein  27.27 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01150  hypothetical protein  26.95 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3427  hypothetical protein  26.49 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0498  hypothetical protein  28.76 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3346  hypothetical protein  26.71 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.891873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0482  hypothetical protein  26.71 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1354  hypothetical protein  20.67 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1466  hypothetical protein  20.67 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0340  hypothetical protein  38.57 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2839  hypothetical protein  27.03 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3016  hypothetical protein  22 
 
 		 268 aa  44.3  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2759  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4952  hypothetical protein  24.65 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_003296  RS05481  hypothetical protein  32.31 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0330  hypothetical protein  22.06 
 
 		 152 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26978  normal  0.735549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5260  hypothetical protein  27.69 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5024  hypothetical protein  27.69 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179023  normal  0.0893042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3343  hypothetical protein  27.69 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>