25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3427 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3427  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3016  hypothetical protein  30.45 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2759  hypothetical protein  31.34 
 
 		 197 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_003296  RS05481  hypothetical protein  28.37 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1503  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0168  hypothetical protein  26.57 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  26.49 
 
 		 155 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4952  hypothetical protein  28.71 
 
 		 140 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01150  hypothetical protein  25.87 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1161  hypothetical protein  32.35 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1608  hypothetical protein  26.92 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  25.69 
 
 		 155 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5260  hypothetical protein  27.72 
 
 		 140 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5024  hypothetical protein  27.72 
 
 		 140 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179023  normal  0.0893042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3343  hypothetical protein  27.72 
 
 		 140 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0052  hypothetical protein  26.92 
 
 		 135 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  25.69 
 
 		 173 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2695  hypothetical protein  24.44 
 
 		 148 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0649  hypothetical protein  29.41 
 
 		 147 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.62119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  22.7 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2839  hypothetical protein  23.13 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0329  hypothetical protein  23.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 449 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0402  hypothetical protein  23.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>