27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1608 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1608  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  306  8e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2695  hypothetical protein  93.92 
 
 
148 aa  289  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0649  hypothetical protein  71.72 
 
 
147 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.62119  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1161  hypothetical protein  71.64 
 
 
135 aa  200  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1503  hypothetical protein  71.64 
 
 
135 aa  199  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0419  hypothetical protein  71.64 
 
 
135 aa  199  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0052  hypothetical protein  71.64 
 
 
135 aa  199  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0648  hypothetical protein  36.88 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0586  hypothetical protein  36.73 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3078  hypothetical protein  36.17 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0615  hypothetical protein  35.46 
 
 
153 aa  92  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.218761  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05481  hypothetical protein  30.22 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4952  hypothetical protein  28.06 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5260  hypothetical protein  27.34 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.752601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5024  hypothetical protein  27.34 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179023  normal  0.0893042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3343  hypothetical protein  27.34 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0340  hypothetical protein  26.67 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1435  hypothetical protein  29.45 
 
 
173 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3427  hypothetical protein  26.92 
 
 
272 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1321  hypothetical protein  29.45 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967147  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1402  hypothetical protein  29.45 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2569  hypothetical protein  29.45 
 
 
169 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0510  hypothetical protein  29.45 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0239  hypothetical protein  29.45 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1268  hypothetical protein  29.45 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01150  hypothetical protein  26.23 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129716  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0168  hypothetical protein  25.41 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>