34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5260 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5024  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  290  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179023  normal  0.0893042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5260  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  290  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.752601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3343  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  290  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4952  hypothetical protein  92.14 
 
 
140 aa  272  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_003296  RS05481  hypothetical protein  67.63 
 
 
143 aa  205  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0340  hypothetical protein  37.23 
 
 
140 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2569  hypothetical protein  34.07 
 
 
169 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1321  hypothetical protein  34.07 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967147  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1402  hypothetical protein  34.07 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1435  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  93.2  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1268  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67879  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0239  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0510  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0052  hypothetical protein  29.63 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1161  hypothetical protein  29.63 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0649  hypothetical protein  30.94 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.62119  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0419  hypothetical protein  29.63 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1503  hypothetical protein  29.63 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0168  hypothetical protein  30.58 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0615  hypothetical protein  29.71 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.218761  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2695  hypothetical protein  28.15 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01150  hypothetical protein  29.57 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129716  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3078  hypothetical protein  28.99 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0586  hypothetical protein  28.99 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1608  hypothetical protein  27.34 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0648  hypothetical protein  27.54 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3427  hypothetical protein  27.72 
 
 
272 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  23.24 
 
 
155 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0647  hypothetical protein  29.71 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000601182  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  23.24 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  23.57 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6211  hypothetical protein  28.08 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639695  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  27.69 
 
 
155 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3691  hypothetical protein  26.83 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>