31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3107 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  354  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  69.03 
 
 		 155 aa  234  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  60.65 
 
 		 155 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0311  hypothetical protein  41.13 
 
 		 148 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.6815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0323  hypothetical protein  40.43 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.043806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0320  hypothetical protein  40.43 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.726183  normal  0.0158521 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6086  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0402  hypothetical protein  34.04 
 
 		 152 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0329  hypothetical protein  34.04 
 
 		 152 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0346  hypothetical protein  37.78 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0647  hypothetical protein  34.03 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000601182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6211  hypothetical protein  30.92 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3691  hypothetical protein  33.58 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635794  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2839  hypothetical protein  28.67 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0498  hypothetical protein  29.22 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3427  hypothetical protein  25.69 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4952  hypothetical protein  25.87 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3346  hypothetical protein  27.16 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.891873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0482  hypothetical protein  27.16 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01150  hypothetical protein  27.66 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0168  hypothetical protein  26.95 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5260  hypothetical protein  23.24 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5024  hypothetical protein  23.24 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179023  normal  0.0893042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3343  hypothetical protein  23.24 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1354  hypothetical protein  22.82 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1466  hypothetical protein  22.82 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05481  hypothetical protein  26.21 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0340  hypothetical protein  28.79 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3016  hypothetical protein  22.86 
 
 		 268 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0330  hypothetical protein  23.77 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26978  normal  0.735549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>