17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0320 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0320  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  309  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.726183  normal  0.0158521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0323  hypothetical protein  99.32 
 
 
148 aa  308  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.043806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0311  hypothetical protein  99.32 
 
 
148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.6815 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6086  hypothetical protein  41.73 
 
 
152 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847593  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  43.36 
 
 
155 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  40.43 
 
 
155 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  40.43 
 
 
173 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  37.14 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0329  hypothetical protein  35.71 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0402  hypothetical protein  35.71 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3691  hypothetical protein  33.82 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635794  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6211  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639695  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0346  hypothetical protein  36.84 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0647  hypothetical protein  31.21 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000601182  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2839  hypothetical protein  25.71 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351067  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1282  hypothetical protein  27.05 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0340  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>