26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0329 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0402  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  322  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0329  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  322  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0332  hypothetical protein  100 
 
 
56 aa  120  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0311  hypothetical protein  35.71 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.6815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0323  hypothetical protein  35.71 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.043806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0320  hypothetical protein  35.71 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.726183  normal  0.0158521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6086  hypothetical protein  34.04 
 
 
152 aa  87.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847593  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  32.37 
 
 
155 aa  87  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  34.04 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  34.04 
 
 
173 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6211  hypothetical protein  28.99 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639695  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0346  hypothetical protein  31.58 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3691  hypothetical protein  29.71 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635794  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0647  hypothetical protein  30.71 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000601182  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0340  hypothetical protein  28 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0168  hypothetical protein  26.35 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2839  hypothetical protein  30 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351067  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0498  hypothetical protein  26.14 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1354  hypothetical protein  25.5 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1466  hypothetical protein  25.5 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01150  hypothetical protein  24.82 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129716  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3346  hypothetical protein  25 
 
 
165 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.891873  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0482  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3016  hypothetical protein  22.94 
 
 
268 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3427  hypothetical protein  23.33 
 
 
272 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>