36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0168 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0168  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  297  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01150  hypothetical protein  99.29 
 
 
144 aa  290  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129716  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05481  hypothetical protein  29.2 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5260  hypothetical protein  30.58 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.752601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4952  hypothetical protein  30.58 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3343  hypothetical protein  30.58 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5024  hypothetical protein  30.58 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179023  normal  0.0893042 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2569  hypothetical protein  31.97 
 
 
169 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1435  hypothetical protein  31.97 
 
 
173 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1402  hypothetical protein  31.97 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1321  hypothetical protein  31.97 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967147  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1268  hypothetical protein  31.4 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67879  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0239  hypothetical protein  31.4 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0510  hypothetical protein  31.4 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3427  hypothetical protein  26.57 
 
 
272 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0649  hypothetical protein  30.08 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.62119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  27.27 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0329  hypothetical protein  26.35 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0402  hypothetical protein  26.35 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1503  hypothetical protein  29.51 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0419  hypothetical protein  29.51 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0340  hypothetical protein  24.44 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1161  hypothetical protein  28.12 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  26.95 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  26.95 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  23.4 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1608  hypothetical protein  25.41 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2695  hypothetical protein  25.4 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0052  hypothetical protein  25.74 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3016  hypothetical protein  23.97 
 
 
268 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0647  hypothetical protein  26.24 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000601182  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0615  hypothetical protein  24.48 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.218761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3078  hypothetical protein  23.78 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0648  hypothetical protein  23.78 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0346  hypothetical protein  32.86 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0586  hypothetical protein  25 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>