28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0052 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0052  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  277  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1503  hypothetical protein  82.96 
 
 		 135 aa  239  7.999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0419  hypothetical protein  82.96 
 
 		 135 aa  239  7.999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1161  hypothetical protein  82.22 
 
 		 135 aa  238  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2695  hypothetical protein  72.39 
 
 		 148 aa  205  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1608  hypothetical protein  71.64 
 
 		 148 aa  199  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0649  hypothetical protein  70.9 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.62119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0648  hypothetical protein  38.24 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3078  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0586  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0615  hypothetical protein  36.76 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.218761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4952  hypothetical protein  31.11 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_003296  RS05481  hypothetical protein  31.85 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5260  hypothetical protein  29.63 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5024  hypothetical protein  29.63 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179023  normal  0.0893042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3343  hypothetical protein  29.63 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0340  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1435  hypothetical protein  28.89 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1402  hypothetical protein  28.89 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1321  hypothetical protein  28.89 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967147  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2569  hypothetical protein  28.89 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0510  hypothetical protein  28.89 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0239  hypothetical protein  28.89 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1268  hypothetical protein  28.89 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67879  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3427  hypothetical protein  26.92 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0168  hypothetical protein  25.74 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01150  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2759  hypothetical protein  26.24 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.826436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>